In silico study to molecular docking study testing the activity of clove flower essential oil components (Syzigium aromaticum (L)) as anti-breast cancer on EGFR receptors

Atmoko, Halizah Damay; Pangestuti, Irsya Riyani; Maulina, Erisa; Kusuma, Tiara Mega; Wardani, Arief Kusuma; Kaltsum, Ummu

doi:10.1063/5.0120359

Cited by 1 publication

(1 citation statement)

References 8 publications

Supporting

Mentioning

Contrasting

Unclassified

Order By: Relevance

“…RMSD adalah jarak deviasi dari posisi pengikatan ligan asli ke protein setelah docking ke posisi pengikatan ligan asli yang sebenarnya. Nilai RMSD ini bisa juga disebut dengan jarak ikatan [13]. Nilai RMSD penting untuk program docking karena dapat mengetahui apakah prediksi modus ikatan berhasil atau tidak.…”

Section: Validasi Metode Dockingunclassified

Studi in silico senyawa golongan flavonoid dari ranting dan akar dadap serep (Erythrina subumbrans) sebagai antipiretik

Montero,

Wardani

2024

JPS

Self Cite

View full text Add to dashboard Cite

Studi in silico menawarkan dunia yang menarik di mana peneliti menggunakan kekuatan komputasi untuk menjelajahi berbagai fenomena ilmiah. In silico memungkinkan peneliti untuk secara virtual menguji ribuan senyawa potensial termasuk bahan alam dalam interaksi dengan target biologis. Hal ini dapat mempercepat waktu proses penemuan obat dan mengurangi ketergantungan pada uji coba laboratorium yang mahal. Dadap serep (Erythrina subumbrans) adalah tanaman golongan keluarga Papilonaceae yang secara uji fitokimia dilaporkan memiliki kandungan flavonoid yang diduga memiliki efek antipiretik. Tujuan penelitian ini adalah untuk menentukan senyawa yang paling berpotensi sebagai antipiretik diantara delapan senyawa golongan flavonoid dari ranting dan akar Dadap Serep (Erythrina subumbrans). Penelitian ini menggunakan metode molecular docking. Pengujian dilakukan terhadap delapan senyawa golongan flavonoid dari ranting dan akar Dadap Serep (Erythrina subumbrans) yaitu pinocembrin; 3,6,4’-trihydroxyflavone; 3,6- dihydroxyflavone; lupalbigenin; erysubin F; genistein; 5-hydroxysophoranone dan abyssinone V, serta kontrol positif paracetamol terhadap protein target dengan kode PDB: 1CX2. Analisis data dilakukan dengan cara membandingkan skor total energi ikatan dan ikatan hidrogen pada residu asam amino yang muncul. Hasil uji menunjukkan bahwa tiga senyawa yang paling berpotensi sebagai antipiretik adalah lupalbigenin, erysubin F, dan abyssinone V dengan skor total energi ikatan berturut-turut -126,3 kkal/mol; -113,1 kkal/mol dan -111,8 kkal/mol.

show abstract

Section: Validasi Metode Dockingunclassified