Naturstoffe sind eine ergiebige Quelle fürA ntibiotika, die vielfältige zelluläre Zielstrukturen adressieren. Die Erforschung ihrer Zielproteine mittels chemischer Proteomik wird häufig durch das Einbringen sterisch anspruchsvoller photoreaktiver Gruppen erschwert. Hier verwenden wir Elegaphenon, ein weitestgehend uncharakterisiertes Naturstoffantibiotikum mit einem nativen Benzophenongrundgerüst füra ffinitätsbasiertes Protein Profiling (AfBPP) in grampositiven und gramnegativen Bakterien. In dieser Studie wurde das Naturstoffgerüst alkinyliert und als Sonde verwendet wodurch es gelungen ist, den Transkriptionsregulator AlgP als biologisches Angriffsziel aufzudecken. Weiterhin wurden durch Proteomprofiling einer Pseudomoas aeruginosa AlgP-Transposonmutanten einzigartige Erkenntnisse über den Wirkmechanismus gewonnen. Elegaphenon verstärkt die Eliminierung intrazellulärer P. aeruginosa in Makrophagen bei Behandlung mit dem Fluorchinolonantibiotikum Norfloxacin in subinhibitorischen Konzentrationen.