O mercado de alimentos orgânicos cresce a cada ano, porém poucas são as pesquisas que abordam esse sistema de produção. Assim, objetivou-se com esta pesquisa avaliar e comparar, em termos quantitativos, qualitativos e econômicos, a produção orgânica de minitomateiro em vasos e canteiros associados às diferentes doses de biofertilizante em três ambientes de casas de vegetação com controle micrometeorológico parcial. A pesquisa foi desenvolvida no campo experimental da Faculdade de Engenharia Agrícola (Feagri/Unicamp), com a cultivar Carolina, conduzida no espaçamento 0,5 x 0,9 m em duas hastes com manejo da adubação orgânica e sistema de irrigação por gotejamento automatizado. Em cada casa de vegetação, utilizou-se o delineamento experimental inteiramente casualizado (DIC) em esquema de parcelas subdivididas com dez tratamentos e cinco repetições. Posteriormente, os dados foram agrupados e reavaliados em análises conjuntas. Os resultados das análises mostraram pouca relevância estatística das doses de biofertilizante sobre as variáveis analisadas, entretanto estas foram significativamente melhores nos canteiros em todas as casas de vegetação, com destaque para a casa de vegetação B quando analisado conjuntamente. As condições micrometeorológicas não foram alteradas entre os ambientes de produção, permanecendo a temperatura e a umidade relativa do ar dentro da faixa adequada para a cultura. A casa de vegetação C, com tela termorrefletora fixa, apresentou a maior altura e o menor diâmetro da haste das plantas, associada à forma de cultivo em vasos, com melhor qualidade dos frutos em termos de sólidos solúveis. A casa de vegetação B, com controle temporal automatizado da tela termorrefletora, mostrou maior produtividade na forma de cultivo em canteiros, bem como a unidade de produção com área mínima de 500 m 2 para as condições de investimento, com período payback de 6,54 anos em condições de financiamento pelo Pronaf. A aplicação do biofertilizante Microgeo® via solo não indicou acréscimos produtivos e qualitativos significativos no cultivo do minitomate orgânico.