Isolation and characterization of gene sequences expressed in cotton fiber

Abstract

-Cotton fiber are tubular cells which develop from the differentiation of ovule epidermis. In addition to being one of the most important natural fiber of the textile group, cotton fiber afford an excellent experimental system for studying the cell wall. The aim of this work was to isolate and characterise the genes expressed in cotton fiber (Gossypium hirsutum L.) to be used in future work in cotton breeding. Fiber of the cotton cultivar CNPA ITA 90 II were used to extract RNA for the subsequent generation of a cDNA library. Seventeen sequences were obtained, of which 14 were already described in the NCBI database (National Centre for Biotechnology Information), such as those encoding the lipid transfer proteins (LTPs) and arabinogalactans (AGP). However, other cDNAs such as the B05 clone, which displays homology with the glycosyltransferases, have still not been described for this crop. Nevertheless, results showed that several clones obtained in this study are associated with cell wall proteins, wall-modifying enzymes and lipid transfer proteins directly involved in fiber development.Key words: Gossypium hirsutum L.. cDNA Library. Transfer proteins. Arabinogalactan. Glycosyltransferase.RESUMO -As fibras de algodão são células tubulares que se desenvolvem a partir da diferenciação da epiderme do óvulo. Além de serem uma das mais importantes fibras naturais do grupo têxtil, as fibras do algodão fornecem um excelente sistema experimental para o estudo da parede celular. Este trabalho teve por objetivo o isolamento e a caracterização de genes expressos em fibras de algodão (Gossypium hirsutum L.) para serem empregados futuramente em trabalhos de melhoramento do algodão. Fibras da cultivar de algodão CNPA ITA 90 II foram utilizadas para extração de RNA e posterior geração de uma biblioteca de cDNAs. Foram obtidas 17 sequências, dentre estas 14 já se encontram descritas em banco de dado do NCBI (National Center for Biotechonology Information), tais como as codificadoras das proteínas transportadoras de lipídios (LTPs) e das arabinogalactana (AGP). No entanto, outros cDNAs, como o clone B05, que apresenta homologia com as glicosiltransferases, ainda não foi descrito para esta cultura. Porém, os resultados indicaram que vários clones obtidos neste trabalho estão associados a proteínas da parede celular, enzimas modificadoras de parede e proteínas de transferência de lipídeo, envolvidas diretamente no desenvolvimento da fibra. Palavras-chave:Gossypium hirsutum L.. Biblioteca de cDNA. Proteínas de transferência. Arabinogalactana. Glicosiltransferase.

Genome-wide association study of cassava starch paste properties

“…In addition, glycosyltransferases act in the antioxidative system, which is related to the neutralization and elimination of free radicals, thus preventing damage to biomolecules [73]. The glycosyltransferases, together with the glycosidases, comprise a group of enzymes of great importance in the biosynthesis and remodeling of the cell wall of carbohydrate polymers during different stages of plant development [74].…”