Introducción. Las bacterias del género Rickettsia son agentes causales de las rickettsiosis, enfermedades zoonóticas endémicas en México. En Yucatán, ocurrió un brote en habitantes de Bolmay; sin embargo, no se identificó el probable artrópodo transmisor. Objetivo. Reportar la presencia de Rickettsia spp. en garrapatas infestando perros domésticos de Bolmay.Material y métodos. Se trabajaron 105 viales con hasta ocho garrapatas. Se extrajo ADN de los ectoparásitos, posterior a la identificación del ciclo de desarrollo vital, la diferenciación sexual, género y especie. Se realizaron dos PCR para aislar fragmentos de los genes htrA (17-kDa) y rOmpB, pertenecientes a Rickettsia spp. Los productos positivos fueron secuenciados y analizados con la herramienta BLAST y el algoritmo Megablast. Resultados. Se utilizaron 291 garrapatas de los géneros Amblyomma (55.7%, 162/291), Rhipicephalus (34%, 99/291) e Ixodes (10.3%, 30/291), y las especies: Rhipicephalus sanguineus sensu lato, Ixodes affinis, Amblyomma cajennense y Amblyomma ovale. La positividad por PCR fue de 11.4% (12/105) para los géneros Amblyomma (66.7%, 8/12), Rhipicephalus (25%, 3/12) e Ixodes (8.3%, 1/12), y las especies A. cajennense, Rh. sanguineus s. l. e I. affinis. Se identificó ADN rickettsial en ninfas, larvas y adultos, y en machos y hembras. El análisis BLAST arrojó un 99% de cobertura e identidad con secuencias de Rickettsia spp.Conclusión. Los géneros y algunas especies de garrapatas infestando perros de Bolmay, probablemente están involucrados en el ciclo de transmisión de Rickettsia spp. a los habitantes. Se presenta la primera evidencia molecular de Rickettsia spp. en garrapatas I. affinis de Yucatán, México.