Kajian Dok Molekul Mengenai Interaksi antara RNA-Bergantung RNA Polimerase Virus Denggi dan Analog Nukleosida

Abstract

RNA-dependent RNA polymerase (RdRp) enzyme is an attractive drug target to treat dengue infection. Nucleoside analogues (Tan et al. 1996).RdRp DENV terletak di kawasan terminal-C NS5 dan mempunyai tiga subdomain yang dinamakan sebagai tapak tangan, jari dan ibu jari (Malet et al. 2008). Subdomain tapak tangan mengandungi tapak aktif dan terdiri daripada dua benang-β tidak selari yang dikelilingi oleh lapan helix-α. Dua motif utama iaitu motif A (Asp533) dan motif C (Asp663) memainkan peranan penting dalam mekanisme pemangkin oleh enzim ini (Steitz 1998). Subdomain jari pula terdiri daripada dua hujung jari dan teras. Salah satu daripada hujung jari mempunyai motif F yang menyediakan tapak pengikat nukleotida trifosfat (NTP) dalam replikasi RNA (Bruenn 2003). Motif E yang berperanan sebagai perangsang sediaan NTP terkandung di dalam subdomain ibu jari (Adachi et al. 2002).