Karakterisasi Fenotip dan Indeks Similaritas Isolat Actinomycetes yang Memiliki Kemampuan Antibakteri terhadap Escherichia coli dan Staphylococcus aureus

Abstract

Eksplorasi kandidat mikrobia penghasil antibiotik semakin meningkat sebagai solusi banyaknya bakteri resisten terhadap antibiotik yang telah ada. Pada penelitian sebelumnya telah didapatkan empat isolat Actinomycetes yaitu ACB34a, ACB44c, ACB54c dan ACB55c yang memiliki kemampuan antibakteri, sehingga diperlukan identifikasi jenis isolate sampai tingkat Genus. Tujuan penelitian ini adalah mengidentifikasi jenis isolat yang terpilih (ACB34a, ACB44c, ACB54c dan ACB55c) berdasarkan karakteristik fenotip, dan menentukan indeks similaritas antarisolatnya. Identifikasi isolat dilakukan menggunakan karakter fenotip yang meliputi morfologi, fisiologi, biokimia dan dilanjutkan pengolahan numerik. Analisis data secara deskriptif dan numerik menggunakan Clad97. Hasil penelitian menunjukkan dua isolat Actinomycetes (ACB34a dan ACB55c) memiliki kemiripan dengan Genus Actinomadura. Sedangkan dua isolate berikutnya, yaitu ACB44c dan ACB54c masing-masing mirip dengan Genus Nocardia dan Streptomyces. Nilai indeks similaritas antara isolat ACB34a dan ACB55c adalah 0,856, selanjutnya isolat ACB54c dan ACB44c memiliki kesamaan 0,788, dan isolat ACB55c dan ACB34a memiliki kesamaan sebesar 0,7788.

Potential of Actinomycetes from Bora Hot Springs Central Sulawesi to Produce Antibacterial Compounds

“…Based on the observations, it appears that fifth isolates have different characters but there are also some characters that shows similar. This result in-line with previous research by Sulistyanto & Trimulyono [4]. The differences that occur in each character of Actinomycetes isolates are caused by the different biological role of each isolate [5].…”

“…2 and Table 2). This is in-line with the study from Sulistyanto & Trimulyono which is all of their Actinomycetes isolates obtained were Gram positive [4]. Fifth isolates had various sizes ranging from 1.20 μm to 1.59 μm.…”

“…Another similarity with previous research are isolates AB-1 and AB-4 with convex elevation, isolates AB-2 and AB-5 with white colonies. This is also in-line with the study from Sulistyanto & Trimulyono which had isolates with convex elevation characteristics and white colonies [4]. In microscopic observations carried out by Gram staining, fifth isolates had coccus cell shape and belongs to Gram positive (Fig.…”

Identifikasi Secara Fenotipik dan Genomik Isolat Bakteri Potensial Pendegradasi Herbisida Glifosat dari Rhizosfer Cabai Rawit

“…Identifikasi bakteri secara fenotipik dan genomik bakteri memiliki kelebihan dan kekurangan. Identifikasi bakteri dengan uji fenotipik tidak dapat mengidentifikasi hingga tingkat strain (Sulistyanto & Trimulyono, 2019). Selain itu, dapat terjadi kesalahan dalam membedakan spesies dan strain bakteri karena terdapat karakter fenotip bakteri yang tidak biasa, misalnya spesies Mycoplasma tidak dapat diidentifikasi secara fenotipik karena membutuhkan waktu lama untuk ditumbuhkan (Celebi et al, 2022;Nuroniyah & Putra, 2012dalam Rosahdi et al, 2019.…”

Meta Analisis Populasi Kuskus (Ailurops sp. & Strigocuscus sp.) dan Upaya Pelestarian Habitat Kuskus di Kepulauan Sulawesi

“…Berdasarkan pada hasil perhitungan indeks similaritas, maka diketahui nilai indeks paling tinggi adalah pada dataran rendah, yaitu 0,92 dilanjutkan dengan dataran tinggi sebesar 0,76 dan dataran sedang sebesar 0,54. Nilai indeks similaritas menurut Magurran (1982) dalam Sulistyanto & Trimulyono (2019), adalah antara 0-1. Nilai yang kian mendekati 1 diartikan memiliki kesamaan yang kian tinggi (Sirait et al, 2018).…”