Tujuan penelitian ini adalah untuk mengkaji bidoversitas iktiofauna di aliran Sungai Progo dalam menentukan tingkat keragaman ikan dan status sumberdaya ikan di sungai Progo dengan menggunakan Sistem Informasi Geografis (SIG). Metode pengambilan sampel dilakukan secara Purposive Sampling (sesuai kebutuhan penelitian) di 17 stasiun penelitian. Data yang di ambil meliputi titik koordinat, Indeks keanekaragaman (H’), Indeks kemerataan (E), Indeks dominansi (D), dan Kelimpahan relative (Kr) , serta pembuatan peta sebaran ikan sungai progo dengan Arcgis. Hasil penelitian menunjukkan nilai indeks keanekaragaman (H’) menunjukkan nilai sedang dan tinggi dengan kisaran nilai 2,24 sampai 3,83, dengan komposisi hasil tangkapan terdiri dari 23 spesies dan 11 famili. Nilai indeks kemerataan (E) sungai progo berkisar antara 0,71 sampai 1,21. Berdasarkan nilai tersebut sungai progo memiliki nilai kemerataan antara spesies relatif merata atau jumlah individu masing-masing spesies relatif sama. Nilai indeks dominansi sungai progo berkisar antara 0,002-0,008 yaitu tidak ada spesies ikan yang mendominasi. Kelimpahan relatif (Kr) jumlah tertinggi yakni ikan balar (Barbonymus balleroides) = 0,12%, ikan melem (Osteochilus vittatus) = 0,11 %, ikan uceng (Nemacheilus fasciatus) 0,09%, ikan nila (Oreochromis niloticus) 0,08%, Sedangkan terendah adalah ikan kekel (Glyptothorax platypogon) dan ikan sepat (Trichopodus trichopterus) dengan nilai 0,01%. Hasil Analisa sebaran ikan di sungai progo menunjukkan bahwa ikan banyak tersebar pada Kawasan sungai yang mempunyai karakteristik perairan yang dalam dan tenang hal ini ditunjukkan dengan jumlah hasil tangkapan pada masing-masing stasiun penelitian.