Objective:The relationship between variants of the leptin gene (LEP) and obesity and metabolic biomarkers was investigated in Brazilian individuals. Subjects and methods: One-hundred-ten obese (BMI > 30 kg/m 2 ) and 100 non-obese individuals (145 women and 65 men, aged 49 ± 14 years) were randomly selected. Plasma leptin, glycemia, serum lipid measurements and LEP -2548G>A and 3'HVR polymorphisms were analyzed. Results: The LEP -2548GG genotype was associated with a 2.2% and 2.0% increase in BMI (p = 0.009) and plasma leptin (p = 0.031), respectively. 3'HVR I/II (classes I/I+I/II) genotypes contributed with 1.8% of BMI values (p = 0.046). LEP I/G combined genotypes (I/IGG, I/IGA and I/IIGG) were associated with obesity, and increased BMI, waist circumference, leptin and triglycerides (p < 0.05). These relationships were found in women (p < 0.05) but not in men. LEP I/G combined genotypes were not associated with hypertension, hyperglycemia, dyslipidemia and coronary artery disease. Conclusions: LEP I/G combined genotypes are associated with obesity-related metabolic biomarkers and phenotype in a gender-dependent manner. Arq Bras Endocrinol Metab. 2010;54(3):282-8 Keywords Leptin; gene polymorphism; obesity; metabolic biomarkers; plasma leptin rEsUMO Objetivo: A relação entre as variantes do gene da leptina (LEP) e obesidade e biomarcadores metabólicos foi investigada em indivíduos brasileiros. Sujeitos e métodos: Cento e dez indiví-duos obesos (IMC > 30 kg/m 2 ) e 100 não obesos (145 mulheres e 65 homens, idade 49 ± 14 anos) foram selecionados aleatoriamente. Leptina plasmática, glicemia, lípides séricos e polimorfismos LEP -2548G>A e 3'HVR foram analisados. Resultados: O genótipo -2548GG foi associado com aumento de 2,2% e 2,0% no IMC (p = 0,009) e leptina plasmática (p = 0,031), respectivamente, enquanto os genótipos 3´HVR I/II (classes I/I+I/II) contribuíram com 1,8% dos valores de IMC (p = 0,046). Os genótipos combinados LEP I/G (I/IGG, I/IGA e I/IIGG) foram associados com obesidade e IMC aumentado, circunferência abdominal, leptina e triglicérides aumentados (p < 0,05). Essas relações foram encontradas em mulheres (p < 0,05), mas não em homens. Os genótipos LEP I/G combinados não foram associados com hipertensão, hiperglicemia, dislipidemia e doença arterial coronariana. Conclusões: Genótipos combinados LEP I/G são associados com biomarcadores metabólicos e fenótipo de obesidade de forma gênero-dependente. Arq Bras Endocrinol Metab. 2010;54(3):282-8 Descritores Leptina; polimorfismo genético; obesidade; biomarcadores metabólicos; leptina plasmática