Liquid chromatography–mass spectrometry in metabolomics research: Mass analyzers in ultra high pressure liquid chromatography coupling

Forcisi, Sara; Moritz, Franco; Kanawati, Basem; Tziotis, Dimitrios; Lehmann, Rainer; Schmitt‐Kopplin, Philippe

doi:10.1016/j.chroma.2013.04.017

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“…In such a scale-free network, highly inter-connected nodes tend to cluster together while sparsely connected ones are peripherally dispersed. Netcalc increases the percentage of m/z peaks, which can be assigned to a preliminary formula up to a 40e60% per dataset including isotope peaks 13 C. 6 The goal of this model is the visual and mathematical evaluation of organic molecular complexity in terms of elemental composition, an approach that permits explicitly defined relationships between different samples. 25 …”

Section: Network Analysismentioning

confidence: 99%

Integrating analytical resolutions in non-targeted wine metabolomics

et al. 2015

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Section: Network Analysismentioning

confidence: 99%

Integrating analytical resolutions in non-targeted wine metabolomics

et al. 2015

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“…However, efficiency in the study of small molecules with m/z <300 by TOF analysis is often hindered by technical limitations such as lower mass accuracy, dynamic range, and multiplexing performance compared to an orbitrap, so the application of MetaboList with TOF instruments should be evaluated separately [8,[13][14][15].…”

Section: Ms/ms Ms E and Ms Allmentioning

confidence: 99%

A Survey of Orbitrap All Ion Fragmentation Analysis Assessed by an R MetaboList Package to Study Small-molecule Metabolites

Sentandreu

Peris‐Díaz

Sweeney

et al. 2018

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“…16,[33][34][35][36] É uma técnica analítica que apresenta alta robustez, sensibilidade e seletividade, além de ser de fácil operação. 37 LC-MS é considerada uma técnica abrangente no que se refere à classe de compostos a serem analisadas, devido a grande variedade de fases estacionárias disponíveis, além dos diferentes modos de separação, como a eluição em fase reversa (fundamentalmente partição), com ou sem pareamento iônico, interação hidrofílica, e troca iônica.…”

Section: Figura 1 Esquema Resumido Do Fluxograma De Trabalho Envolviunclassified

Metabolômica: Definições, Estado-Da-Arte E Aplicações Representativas

Canuto¹,

Costa²,

Cruz³

et al. 2017

Quim. Nova

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METABOLOMICS: DEFINITIONS, STATE-OF-THE-ART AND REPRESENTATIVE APPLICATIONS.Metabolomics is an emerging and promising omics approach used to understand biological mechanisms. By untargeted and targeted metabolomics analyses, metabolites are determined in biological samples (fluids, cells, tissues, etc.) by comparison of control groups with altered groups, undergoing different therapies, submitted to differing stress levels, dietary modulation, or promoted by a disease, or specific condition, etc., using sophisticated analytical techniques, and advanced data treatment and statistical analyses. In this review, the concepts involved in metabolomics studies were presented, describing in details all steps involved in the metabolomics workflow, for untargeted and targeted strategies. Finally, the potential of metabolomics is illustrated by applications in representative areas: clinical, environmental, food and nutrition, forensic toxicology, microbiology, parasitology, plants, and sports. Relevant reviews were compiled to characterize each of these areas, and a corresponding application of untargeted and targeted metabolomics were described.Keywords: metabolomics; untargeted metabolomics; targeted metabolomics; metabolomics workflow. INTRODUÇÃOAs ciências ômicas buscam o entendimento do funcionamento celular dos organismos e suas alterações biológicas. Fazem parte deste conjunto de ciências, a genômica (estudo da alteração dos genes), a transcriptômica (estudo das alterações dos transcritos), a proteômica (estudo das alterações das proteínas), e a metabolômica (estudo das alterações dos metabólitos). Metabólitos são produtos intermediários ou finais do metabolismo em uma amostra biológica.1 O conjunto de todos os metabólitos de baixa massa molecular (até 1500 Da), presentes ou alterados em um sistema biológico, é chamado de metaboloma (do inglês, metabolome).2 A pesquisa relacionada a metabólitos vem sendo desenvolvida há décadas, mas em 1999, Nicholson et al. definiram a metabonômica (do inglês, metabonomics), como sendo a medida quantitativa da resposta metabólica de um sistema biológico após estímulos fisiopatológicos ou modificações genéticas.3 Já o termo metabolômica (do inglês, metabolomics) foi introduzido em 2001, por Oliver Fiehn, como sendo a análise abrangente e quantitativa do metaboloma de um sistema biológico. 4 Além disso, a literatura nos apresenta outras denominações envolvendo esse campo da ciência, tais como: perfil metabólico (do inglês, metabolic profiling), descrito como sendo a análise de metabólitos previamente selecionados de rotas bioquímicas específicas, 5 a impressão digital metabólica (do inglês, metabolic fingerprinting), que é definida como sendo "uma classificação de amostras de acordo com sua origem ou sua relevância biológica", 3 e, por último, análise footprinting (ainda sem tradução para o português), para se referir aos metabólitos excretados por uma célula em condições controladas. Observa-se, portanto, uma divergência em relação às terminologias aplicadas às análises metabolômic...

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Liquid chromatography–mass spectrometry in metabolomics research: Mass analyzers in ultra high pressure liquid chromatography coupling

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Integrating analytical resolutions in non-targeted wine metabolomics

Integrating analytical resolutions in non-targeted wine metabolomics

A Survey of Orbitrap All Ion Fragmentation Analysis Assessed by an R MetaboList Package to Study Small-molecule Metabolites

Metabolômica: Definições, Estado-Da-Arte E Aplicações Representativas

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