SUMMARY: Fish regulate egg production by atresia. Sometimes, oocytes are encapsulated in cystic structures that might remain in the ovary for months, altering female reproductive potential in future spawning seasons. Ovaries of Atlantic cod (Gadus morhua, L.) from the Flemish Cap and European hake (Merluccius merluccius, L.) from the Galician Shelf (NW Spain) were analysed from 1999 to 2006. The prevalence and abundance of ovarian cysts were estimated. Cyst prevalence increased with female size and/or age for both species, and decreased with high condition factor in hake. Cyst intensity does not correlate with any analysed factor. The size/age structure of spawning stock biomass and female condition could affect the prevalence of cysts in the ovaries, though it does not seem to affect cyst intensity in the ovary. Further research is needed to determine cyst resorption time and the impact that it has on egg production and consequently on stock reproductive potential.Keywords: European hake, Atlantic cod, cyst, ovarian follicle, condition, reproductive potential. RESUMEN: Incidencia y significancia de las estructuras c铆sticas en ovarios de g谩didos. -Los peces regulan la producci贸n de huevos a trav茅s de la atresia. En ocasiones, los ovocitos son encapsulados en estructuras qu铆sticas que podr铆an permanecer en el ovario durante meses, alterando el potencial reproductivo de las hembras en estaciones de puesta posteriores. Se tomaron ovarios de bacalao (Gadus morhua, L.) de Flemish Cap y de merluza europea (Merluccius merluccius, L.) de la costa gallega (NO Espa帽a) entre 1999 y 2006. Se estim贸 la prevalencia e intensidad de quistes en estos ovarios. En ambas especies la prevalencia de hembras con quistes aument贸 con la talla y/o edad y disminuy贸 al aumentar el factor de condici贸n en el caso de la merluza. La intensidad de quistes no se correlacion贸 con ninguna de las variables estudiadas. La estructura de talla/edades del stock reproductor y la condici贸n de las hembras podr铆a afectar la prevalencia de hembras con quistes. Son necesarios m谩s estudios para determinar el tiempo de reabsorci贸n de estos quistes y las consecuencias que esto puede tener en la producci贸n de huevos y por tanto en el potencial reproductivo de los stocks.Palabras clave: merluza europea, bacalao atl谩ntico, quiste, fol铆culo ov谩rico, condici贸n, potencial reproductivo.