Objetivo: Avaliar interações medicamentosas (IM), em que os riscos se sobrepõem aos benefícios (nível I) ou os benefícios se sobrepõem aos riscos (nível II); a partir da análise retrospectiva de prescrições médicas em um Hospital Universitário no estado de São Paulo, Brasil. Métodos: Foram analisadas 19762 prescrições médicas destinadas à farmácia do hospital, de janeiro a setembro de 2009; com o auxílio de programas sobre IM, para categorizar IM de nível I e II. Resultados: Na análise 26,53% apresentaram IM, em que 23,64% foram classificadas em nível I e 76,35% em nível II. Dentre as IM com maior frequência no nível I, estavam: ácido acetilsalicílico (AAS) e clopidogrel, AAS e heparina, captopril e espironolactona, digoxina e hidroclorotiazida. Houve uma redução em percentual de IM de nível I, comparando janeiro representado por 26,5% e setembro representado por 18,4%. Já nas IM de nível II, tem-se as seguintes associações com maior frequência: AAS e propranolol, AAS e insulina regular humana, AAS e atenolol, AAS e enalapril, AAS e carvedilol. Conclusão: A atuação dos farmacêuticos colaborou à redução de IM de nível I, devido à intervenção por meio de comunicação estabelecida com os prescritores; sinalizando a importância da equipe interprofissional em saúde.