Mapas genéticos em plantas

Abstract

RESUMOAo lado dos projetos de seqüenciamento e das análises do cariótipo pelas técnicas de hibridização in situ, o desenvolvimento de mapas genéticos fundamentados em marcadores de DNA tem propiciado consideráveis avanços à genômica de plantas. Esta revisão aborda as premissas básicas utilizadas para o mapeamento genético e suas principais aplicações, especialmente para o melhoramento vegetal. Fundamentos teóricos sobre segregação, recombinação e ligação são considerados e relacionados à construção de mapas genéticos com marcas moleculares. Apresentam-se informações sobre tipos de marcadores, populações de mapeamento, cálculo da freqüência de recombinação, distorções da segregação, estabelecimento dos grupos de ligação e da ordenação dos marcadores. Discute-se, também, o uso de mapas de ligação em programas de seleção assistida por marcadores, na clonagem de genes e em estudos sobre sintenia. Palavras-chave: mapas de ligação, marcadores moleculares, QTL, mapeamento comparativo. ABSTRACT GENETIC MAPS IN PLANTSIn addition to genome projects and karyotype analysis by in situ hybridization techniques, a major advance in plant genome analysis came from the development of genetic maps based on molecular markers (Figure 1). This review clarifies the basic premises used for genetic mapping and its main applications, especially in plant breeding. The theories of segregation, recombination and linkage are considered and related to the construction of genetic maps based on molecular markers. Information about marker types, population mapping, calculation of the recombination rate, segregation distortion, linkage groups and genetic order determination is presented. Exploitation of linkage mapping for marker assisted selection, gene cloning and synteny comparisons is discussed.

Seleção Genômica Ampla (Gws) E Associação Genômica Ampla (Gwas) No Melhoramento De Forrageiras: Abordagem Conceitual, Genética Quantitativa E Aplicações

“…A construção de mapas genéticos é considerada uma das ferramentas de maior impacto da tecnologia de marcadores moleculares, com amplas aplicações em análises filogenéticas e melhoramento, por meio dos estudos de sintenia (Figura 1), clonagem de genes e, principalmente, a localização de QTLs associados a caracteres de importância econômica (CARNEIRO; VIEIRA, 2002). O mapeamento de QTLs permite conhecer o número e a localização no cromossomo de locos envolvidos na herança complexa, determinar sua ação gênica e a decomposição da interação genótipo x ambiente (GRATTAPAGLIA; FERREIRA, 2016; NAKAYA; ISOBE, 2012).…”

“…Segundo Ferreira e Grattapaglia (2016), a capacidade de detecção de um QTL varia em função da magnitude de seu efeito sobre o caráter de interesse, do tamanho da população segregante analisada, da frequência de recombinação entre o marcador e o QTL e da herdabilidade do caráter. O aumento do poder estatístico e a limitação da ocorrência de falsos positivos também são importantes, principalmente quando há a chamada distorção da segregação mendeliana, causada, também, pela amostragem ou viabilidade diferencial de gametas, devendo ser verificada pelo teste de aderência, que não admite a ocorrência de distorções (CARNEIRO; VIEIRA, 2002).…”

“…Por fim, o ordenamento dos locos é um processo que busca minimizar o número de crossing-overs; assim, diversos métodos podem ser utilizados, aumentando sua complexidade conforme o aumento do número de locos e visando à melhor combinação (CARNEIRO; VIEIRA, 2002). A distância entre dois locos deve manter o caráter poligênico do QTL.…”

Research Article Identification of SSR markers linked to partial resistance to soybean rust in Brazil from crosses using the resistant genotype IAC 100

“…Microsatellite markers are widely used because they are highly reproducible, easy to use and co-dominant (Alcântara Neto, 2001). Co-dominance is extremely important to distinguish homozygous from heterozygous genotypes (Carneiro and Vieira, 2002;Caixeta et al, 2006). The identification of markers linked to resistance enables assisted selection, decreasing the time required to obtain new cultivars through breeding programs (Arahana et al, 2001;Freire et al, 2008).…”

Endosperm genotyping as a strategy to differentiate the allele source in maize heterozygous progeny

“…The segregating population has a critical importance for the success in map construction, thus the importance of parental selection and the crossing-type determination (Carneiro & Vieira, 2002). Lynch & Walsh (1998) distinguished the mapping populations in terms of inbred line crosses and outbred populations.…”