Meaning Inference of Abbreviations Appearing in Clinical Studies

Building a Repository for Inferring the Meaning of Abbreviations Used in Clinical Studies

“…Accordingly, a token was considered to be non-important, on condition that its value was lower than a predefined threshold. In fact, the specified threshold was closely associated with the ABR's length and varied between 0.2 (for 2-character-ABRs) and 0.4 (for rather long ABRs with more than 8 characters) [5].…”

“…In the first case, the "s" character was removed from the ABR, whereas, in the second case the corresponding word (i.e., "positive", in the aforementioned example) was eliminated from both the ABR and candidate-EXP (if present in the latter). The list of commonly used words emerged from a semi-automatic analysis of the compounds formed using ABRs, based on their frequency of appearance [5].…”

“…In this work, we present a fully-automated system developed for detecting the meaning of the ABRs specified in clinicaltrials.gov studies [4]. In the background, innovative algorithms and techniques have been used for ABR recognition purposes, taking into account the "importance" of words, as highlighted in previous work of ours [5]. The system's evaluation has been performed based on an abbreviations-annotated corpus of documents that we developed.…”

Ανάπτυξη Καινοτόμων Σημασιολογικών Μηχανισμών Για Τη Βελτίωση Του Σχεδιασμού Μιας Κλινικής Έρευνας

“…Αρχικά, τα δεδομένα από όλες τις διαθέσιμες κλινικές μελέτες ελήφθησαν (περίπου 195 χιλιάδες κλινικές μελέτες ήταν διαθέσιμες τον Αύγουστο του 2015) και κατόπιν εισήχθησαν σε μία σχεσιακή βάση, συμπεριλαμβανομένων των ΚΚ που είχαν ορισθεί. Για την εύρεση των μεμονωμένων κριτηρίων που είχαν ορισθεί, το κείμενο με τα ΚΚ επεξεργάστηκε, λαμβάνοντας υπόψη συγκεκριμένες λέξεις και φράσεις που καμία άλλη κλινική δοκιμή[49]. Η παραπάνω βάση δεδομένων κατόπιν χρησιμοποιήθηκε για την επιλογή της κατάλληλης σημασίας των συντομεύσεων, λαμβάνοντας υπόψη τα συμφραζόμενα.Στην πραγματικότητα, η ανάλυση έδειξε ότι, όταν ορίζουμε τον πληθυσμό μιας κλινικής δοκιμής, οι ερευνητές ενδιαφέρονται όχι μόνο για την τρέχουσα κατάσταση του ασθενούς ή το ιστορικό του, αλλά και για τη συμπεριφορά και πρόοδό του στο μέλλον…”

“…Τέλος, με τη βοήθεια των τεχνικών που βασίζονται σε επανεμφάνιση της ίδιας λέξης ή φράσης, μπορέσαμε να εντοπίσουμε τη σημασία ενός περιορισμένου αριθμού συντομεύσεων σε σχέση με τις συντομεύσεις που εντοπίσαμε με τις τεχνικές που βασίζονται στην ευθυγράμμιση των χαρακτήρων. βιοϊατρικών συντομεύσεων που ανέρχονται στις 4.61[156].Συνεπώς, η βάση δεδομένων που κατασκευάσαμε διευκολύνει τη διαδικασία εύρεσης της πιθανής σημασίας των συντομεύσεων που δεν ορίζονται στις κλινικές δοκιμές, καθώς δε χρειάζεται να εξετάσουμε επιπρόσθετες πιθανές σημασίες των συντομεύσεων οι οποίες κατά κανόνα δε χρησιμοποιούνται στην περιγραφή των κλινικών μελετών.Περαιτέρω επεξεργασία των συντομεύσεων, και ειδικότερα της σημασίας τους, έδειξε ότι, σε αρκετές περιπτώσεις, υπάρχουν παραπάνω από μία συντομεύσεις για την ίδια σημασία, οι οποίες συνήθως προέρχονται από την ύπαρξη διαφορετικών, σημασιολογικά ισοδύναμων, εκφράσεων[172]. Για παράδειγμα, το φάρμακο azidothymidine (AZT) είναι επίσης γνωστό ως zidovudine (ZDV).…”