Microsatellite based genetic diversity and relationships among ten Creole and commercial cattle breeds raised in Brazil

Abstract

Background: Brazil holds the largest commercial cattle populations worldwide. Local cattle breeds can be classified according to their origin, as exotic or Creole. Exotic breeds imported in the last 100 years, both zebuine and taurine, currently make up the bulk of the intensively managed populations. Locally adapted Creole breeds, originated from cattle introduced by the European conquerors derive from natural selection and events of breed admixture. While historical knowledge exists on the Brazilian Creole breeds very little is known on their genetic composition. The objective of this study was to assess the levels of genetic diversity, phylogenetic relationships and patterns of taurine/zebuine admixture among ten cattle breeds raised in Brazil.

Genetic diversity analysis of the Uruguayan Creole cattle breed using microsatellites and mtDNA markers

“…However, the low number of males with respect to the females affects effective population size (N E ) and F IS index. Stochastic events such as founder effect and genetic drift, acting since the origin of this population, may have affected allelic frequencies and may be the cause of the observed departures from equilibrium (Lirón et al, 2006;Egito et al, 2007;Martín-Burriel et al, 2011). Similar effects caused by similar circumstances were observed by Kantanen et al (2000) in Eastern Finnish cattle.…”

Diversidad genética en bovinos de ocho regiones en Costa Rica.

“…El número de alelos observados en el presente estudio fue similar al 13,2 reportado por Egito et al (2007), pero marcadamente mayor al reportado por otros estudios (Maudet et al, 2002;Steigleder et al, 2004;Villalobos-Cortés et al, 2011;Acosta et al, 2013). Puesto que existe coincidencia en una mayoría de los marcadores analizados por los distintos estudios, la mayor cantidad de alelos detectados podría relacionarse con los factores de mayor tamaño de muestra y mayor cantidad de establecimientos visitados.…”

“…Además, se observó que el valor de He fue 4% mayor (P<0,001) que Ho, lo que implica una deficiencia de heterocigotas. El incumplimiento del equilibrio HW en poblaciones de ganado bovino ha sido reportado en numerosos estudios (Egito et al, 2007;Martín-Burriel et al, 2011;Acosta et al, 2013). La deficiencia de heterocigotas también ha sido reportada en varios estudios con bovinos (Maudet et al, 2002;Egito et al, 2007;Cañón et al, 2008;Martín-Burriel et al, 2011;Acosta et al, 2013).…”

“…Otros valores reportados oscilaron entre -0,06 y 0,10 para diecinueve razas ibéricas (Martín-Burriel et al, 2011), entre 0,04 y 0,12 para diez razas en Brasil (Egito et al, 2007), o entre -0,01 y 0,25 en una revisión de varios estudios (Villalobos-Cortés et al, 2011). Esta gran variación se puede atribuir a diferencias en los patrones de desarrollo y evolución que han tenido las diferentes razas evaluadas en sus respectivos sitios de procedencia.…”

“…Estos fueron menos variables que los reportados por los estudios citados anteriormente (Egito et al, 2007;Martín-Burriel et al, 2011;Villalobos-Cortés et al, 2011;Acosta et al, 2013).…”