Molecular docking of gallic acid as anti-photoaging in silico

Dewi, Ni Kadek Diah Parwati; Suryadewi, Kadek Dinda; Fitriari, Diah Mawarni; Andini, Kadek Lia; Laksmiani, Ni Putu Linda

doi:10.51511/pr.18

Cited by 5 publications

(4 citation statements)

References 19 publications

Supporting

Mentioning

Contrasting

Order By: Relevance

“…Minimalisasi energi total molekul yang dilakukan bertujuan untuk mengoptimalkan kemampuan dari senyawa dalam mendonorkan elektronnya ketika berikatan. Dengan demikian, senyawa akan lebih mudah untuk melakukan ikatan dengan protein target yang dalam hal ini adalah protein MMP-1 [18]. Optimasi hasil optimasi dari galangin dan vitamin C ditampilkan pada gambar 2 dan gambar 3.…”

Section: Hasil Dan Pembahasan 31 Optimasi Struktur 3d Galangin Dan Vi...unclassified

See 1 more Smart Citation

Potensi Galangin Pada Rimpang Lengkuas sebagai Anti-Photoaging dengan Metode Molecular Docking

Ketut Yuantarisa Kartika Putri,

Ni Putu Linda Laksmiani

2023

WSNF

View full text Add to dashboard Cite

Photoaging adalah penuaan pada kulit yang disebabkan oleh paparan sinar ultraviolet. Indonesia merupakan negara tropis yang mendapatkan paparan sinar matahari sepanjang tahun. Kondisi tersebut mengakibatkan masyarakatnya rentan untuk mengalami photoaging. Degradasi kulit disebabkan oleh protein MMP-1 (matrix metalloproteinase-1), sehingga untuk mengatasi photoaging diperlukan agen penghambat MMP-1. Salah satu penghambat MMP-1 yang digunakan secara luas di masyarakat adalah vitamin C. Rimpang lengkuas diketahui sebagai bahan alami yang memiliki aktivitas antioksidan dengan galangin sebagai biomarkernya. Galangin telah dilaporkan secara in vitro dan in vivo mampu meningkatkan ekspresi faktor pertumbuhan fibroblast dan prokolagen. Penelitian ini bertujuan untuk mendukung pembuktian potensi senyawa galangin sebagai anti-photoaging melalui molecular docking terhadap MMP-1dengan vitamin C sebagai kontrol positif. Tahapan yang dilakukan yaitu preparasi dan optimasi senyawa uji menggunakan Hyperchem 8, dan preparasi protein menggunakan Chimera 1.11.1. Validasi dan docking dilakukan menggunakan aplikasi AutoDockTools 1.5.6 dengan program Autodock4 dan Autogrid4. Metode molecular docking yang dilakukan dinyatakan telah valid apabila nilai RMSD yang diperoleh kurang dari 2 Å. Hasil pengujian molecular docking menunjukkan galangin memiliki afinitas terhadap MMP-1 dengan nilai energi ikatan yang negatif yakni -7,92 kkal/mol. Nilai tersebut lebih negatif jika dibandingkan dengan kontrol positif agen anti-photoaging yaitu vitamin C yang memiliki energi ikatan -5,47 kkal/mol terhadap MMP-1. Model interaksi yang dapat divisualisasikan dari ikatan galangin dengan protein target adalah ikatan hidrogen. Berdasarkan hasil docking, diketahui bahwa galangin memiliki potensi sebagai anti-photoaging dengan mekanisme penghambatan MMP-1 dan dapat dianjurkan untuk dikembangkan.

show abstract

Section: Hasil Dan Pembahasan 31 Optimasi Struktur 3d Galangin Dan Vi...unclassified

“…Selanjutnya adalah pengaturan grid box yakni ruang native ligand untuk berinteraksi dengan residu asam amino pada binding site dari makromolekul protein [18]. Dengan demikian, pengaturan grid box dilakukan untuk menyediakan ruang untuk native ligand membentuk posisi atau konformasi selama proses redocking.…”

Section: Validasi Metode Molecular Dackingunclassified

Potensi Galangin Pada Rimpang Lengkuas sebagai Anti-Photoaging dengan Metode Molecular Docking

Ketut Yuantarisa Kartika Putri,

Ni Putu Linda Laksmiani

2023

WSNF

View full text Add to dashboard Cite

show abstract

“…Ligan asiatikosida juga telah diprediksi memiliki energi ikatan paling rendah dengan collagen 1 yaitu sebesar -121.79 kcal/mol [17]. Selain itu, melalui penelitian yang berbeda ligan asam galat juga dilakukan prediksi penambatan dengan target MMP-1 dengan hasil yaitu memiliki energi ikatan -6.0 kcal/mol [33]. Beberapa senyawa golongan flavonoid yang terkandung dalam pegagan juga telah dilakukan pengujian yaitu menggunakan ligan castilliferol dan castillicetin.…”

Section: Aktivitas Anti-photoaging Ekstrak Herba Pegaganunclassified

Potensi Nanostructured Lipid Carrier (NLC) dengan Zat Aktif Ekstrak Herba Pegagan (Centella asiatica (L.) Urb.) sebagai Sediaan Topical Gel Anti-photoaging

Putra¹,

Pradnyaswari²,

Setyawan³

2023

WSNF

View full text Add to dashboard Cite

Paparan sinar UVB berlebih pada kulit akan menstimulasi produksi ROS yang bertanggung jawab dalam stres oksidatif pada kulit dengan merusak serat jaringan ikat sehingga menimbulkan manifestasi klinis berupa kerutan yang kerap disebut sebagai photoaging. Pencegahan photoaging salah satunya dapat dilakukan dengan mengaplikasikan tanaman herbal yang memiliki aktivitas antioksidan yang tinggi seperti herba pegagan. Untuk dapat mengaplikasikan herba pegagan, diperlukan suatu inovasi sediaan yang dapat menghantarkan kandungan senyawa sehingga dapat menghasilkan efek yang optimal salah satunya yaitu menggunakan sistem Nanostructured Lipid Carrier (NLC) yang terinkorporasi dalam basis gel. Artikel ini bertujuan untuk mengetahui potensi dari sistem NLC dengan zat aktif herba pegagan untuk mencegah photoaging. Adapun metode yang digunakan untuk membuat artikel ini yaitu literature review. Hasil yang diperoleh yaitu herba pegagan mengandung berbagai senyawa sehingga mampu memberikan aktivitas antioksidan yang tinggi. Selain itu, tanaman ini juga telah dilakukan pengujian secara in silico dengan molecular docking serta pengujian secara in vitro terhadap beberapa target yang bertanggung jawab dalam terjadinya photoaging. Sistem NLC memiliki stabilitas, kelarutan, serta kemampuan absorpsi zat aktif yang lebih baik. NLC sebagai sistem pembawa zat aktif ekstrak herba pegagan yang terinkorporasi dalam basis gel sangat potensial untuk digunakan sebagai upaya preventif maupun kuratif pada photoaging melalui rute administrasi topikal. Namun diperlukan penelitian lebih lanjut baik secara in vitro, in vivo, uji klinis, serta optimasi formula agar didapatkan sediaan yang mampu memberikan aktivitas anti-photoaging yang optimal dan dapat diterima oleh masyarakat luas.

show abstract

“…Terjadi penurunan energi total setelah dilakukan optimasi geometri. Penurunan energi total mengindikasikan bahwa telah diperoleh struktur tiga dimensi senyawa mirisetin yang stabil (Dewi et al, 2021 seneng dah diah).…”

Section: Optimasi Struktur Tiga Dimensi Mirisetinunclassified

Uji Senyawa Mirisetin Sebagai Antiinflamasi Melalui Pendekatan In Silico Molecular Docking

Suryadewi,

Pratama

2022

AHP

View full text Add to dashboard Cite

Mirisetin merupakan senyawa yang termasuk golongan flavonoid yang dapat ditemukan pada berbagai tumbuhan tropis. Senyawa mirisetin diyakini memiliki aktivitas sebagai antiinflamasi melalui penghambatan enzim penyebab inflamasi. Penelitian in silico dengan dockig molekuler dilakukan untuk mengetahui interaksi mirisetin dengan suatu protein target yaitu caspase-1. Hasil energi ikatan yang diperoleh adalah -5,95 kkal/mol. Nilai energi ikatan yang diperoleh lebih negatif dibandingkan dengan energi ikatan yang dihasilkan oleh native ligand dengan protein target yaitu sebesar -4,21 kkal/mol. Nilai energi ikatan yang lebih negatif menandakan afinitas mirisetin lebih kuat dibandingkan dengan native ligand. Native ligand dan mirisetin berinteraksi melalui ikatan hidrogen melibatkan beberapa residu asam amino. Adanya residu asam amino yang serupa menandakan mirisetin berinteraksi dengan cara yang mirip dengan native ligand dalam menghambat caspase-1.

show abstract

Molecular docking of gallic acid as anti-photoaging in silico

Cited by 5 publications

References 19 publications

Potensi Galangin Pada Rimpang Lengkuas sebagai Anti-Photoaging dengan Metode Molecular Docking

Potensi Galangin Pada Rimpang Lengkuas sebagai Anti-Photoaging dengan Metode Molecular Docking

Potensi Nanostructured Lipid Carrier (NLC) dengan Zat Aktif Ekstrak Herba Pegagan (Centella asiatica (L.) Urb.) sebagai Sediaan Topical Gel Anti-photoaging

Uji Senyawa Mirisetin Sebagai Antiinflamasi Melalui Pendekatan In Silico Molecular Docking

Contact Info

Product

Resources

About