Molecular dynamics simulation of lysine dendrimer and semax peptides interaction

Викторовна, Попова Елена; Валерьевич, Шавыкин Олег; Михайлович, Неелов Игорь; Франц, Лирмэйкерс

doi:10.17586/2226-1494-2016-16-4-716-724

Cited by 7 publications

(3 citation statements)

References 12 publications

Supporting

Mentioning

Contrasting

Unclassified

Order By: Relevance

“…Therapeutic KED peptide (Lys-Glu-Arg) [10][11] was selected for our study as a model peptide. This peptide belongs to a class of regulatory peptides and has an protective properties.…”

Section: Introductionmentioning

confidence: 99%

Computer simulation of complex of lysine dendrigraft with molecules of therapeutic KED peptide

et al. 2019

View full text Add to dashboard Cite

Lysine dendrimers and dendrigrafts are often used in biomedicine for drug and gene delivery to different target organs or cells. In present paper the possibility of complex formation by lysine dendrigraft and 16 molecules of therapeutic KED peptide was investigated using molecular dynamics simulation method. A system containing of one dendrigraftt and 16 KED peptides in water were studied. It was shown that stable complex consisting of the dendrigraft and the peptide molecules formed and structure of this complex was studied. Similar complexes could be used in future for delivery of other therapeutic peptides to target organs.

show abstract

“…Therapeutic KED peptide (Lys-Glu-Arg) [10][11] was selected for our study as a model peptide. This peptide belongs to a class of regulatory peptides and has an protective properties.…”

Section: Introductionmentioning

confidence: 99%

Computer simulation of complex of lysine dendrigraft with molecules of therapeutic KED peptide

et al. 2019

View full text Add to dashboard Cite

show abstract

“…1). Взаимодействие лизиновых дендримеров с некоторыми регуляторными пептидами исследовалось нами ранее [13][14][15][16][17][18][19][20][21][22]. Однако взаимодействие лизиновых дендримеров с молекулами пептида Эпиталон до сих пор практически не изучалось.…”

Section: Introductionunclassified

Computer modeling of interaction of lysine dendrimer with epithalon peptides

Насруллоевна¹,

Владимировна²,

Валерьевич³

et al. 2018

Naučno-teh. vestn. inf. tehnol. meh. opt.

Self Cite

View full text Add to dashboard Cite

Предмет исследования. Дендримеры являются суперразветвленными полимерными молекулами, регулярно ветвящимися из единого центра. Дендримеры используются в биомедицинских приложениях для доставки лекарственных препаратов и генетического материала в клетки. В данной работе исследовано образование комплексов лизиновых дендримеров с терапевтическими тетрапептидами и равновесные свойства этих комплексов. Были изучены две системы, состоящие из одного лизинового дендримера второго поколения и 16 тетрапептидов. В первом случае система состояла из дендримера и 16 свободных молекул пептида Эпиталон. Во втором случае система состояла из дендримера и 16 химически связанных с его концами молекул пептида Эпиталон. Метод. Исследование выполнено с помощью компьютерного моделирования методом молекулярной динамики. Основные результаты. Проведено сравнение размеров и внутренней структуры комплекса и конъюгата молекул пептида с дендримером. Получено, что в случае свободных молекул пептида Эпиталон эти молекулы адсорбируются не только на поверхности, но и проникают внутрь дендримера, образуют с ним стабильный комплекс. В случае конъюгата пептиды меньше проникают внутрь дендримера, но, находясь в основном на его поверхности, поджимают дендример внутрь комплекса, образуя с ним более компактную структуру. Практическая значимость. Подобные комплексы и конъюгаты могут быть использованы в будущем для доставки различных терапевтических пептидов и других лекарственных молекул в органы-мишени. Ключевые слова лизиновый дендример, пептид Эпиталон, компьютерное моделирование, метод молекулярной динамики Благодарности Работа выполнена при государственной поддержке ведущих университетов Российской Федерации (субсидия 08-08). Все вычисления были проведены на суперкомпьютере «Ломоносов» суперкомпьютерного центра МГУ.

show abstract

“…In our previous paper we studied complexes of Semax peptides with lysine dendrimer [11]. The goal of this paper is to study the interaction between lysine dendrigraft of second generation and therapeutic peptide Semax using molecular dynamics method to determine whether the dendrigraft could adsorb peptide molecules and thus could be used for delivery of these peptides into cells.…”

Section: Introductionmentioning

confidence: 99%

Molecular Dynamics Simulation of Interaction of Short Lysine Brush and Oppositely Charged Semax Peptides

Попова¹,

Okrugin²,

Neelov³

2016

View full text Add to dashboard Cite

The possibility of complex formation by short lysine brush and therapeutic Semax peptides was investigated using molecular dynamics method. Lysine dendrimers and polymer brushes are used for drug and other (e.g., DNA, peptides, and polysaccharides) molecules delivery to different target cells. It is known that they could penetrate blood brain barrier. Since short lysine brush is nontoxic, a system containing of such brush and 8 oppositely charged Semax peptides was studied. It was obtained that stable complexes consisting of brush and peptides formed and structures of these complexes were investigated. Such complex can be used in future for delivery of Semax peptides to brain since these peptides have significant antioxidant, antihypoxic and neuroprotective effects.

show abstract

Molecular dynamics simulation of lysine dendrimer and semax peptides interaction

Cited by 7 publications

References 12 publications

Computer simulation of complex of lysine dendrigraft with molecules of therapeutic KED peptide

Computer simulation of complex of lysine dendrigraft with molecules of therapeutic KED peptide

Computer modeling of interaction of lysine dendrimer with epithalon peptides

Molecular Dynamics Simulation of Interaction of Short Lysine Brush and Oppositely Charged Semax Peptides

Contact Info

Product

Resources

About