Molecular Mechanics Calculations as a Tool in Coordination Chemistry

Hancock, Robert D.

doi:10.1002/9780470166383.ch4

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“…[54] The necessary creation of gauche interactions in the course of the complexation results in an open-chain tetramine that binds copper(II) ions a factor of 10 10 less strongly than does the corresponding macrocycle. This principle can be modeled relatively easily by force-field simulations.…”

Section: Induced Fit and Strain Effectsmentioning

confidence: 99%

“…The explanation for this effect is the differing torsionalangle (Pitzer) strains in the resulting metallacyclohexanes or -pentanes, respectively. [54] The necessary creation of gauche interactions in the course of the complexation results in an open-chain tetramine that binds copper(II) ions a factor of 10 10 less strongly than does the corresponding macrocycle. [54a] In a complex of potassium ions with the crown compound [18]crown-5, only 1/6 fewer oxygen atoms are present as potential acceptor centers than in the complex with [18]crown-6, but the binding constant with [18]crown-6 is decreased by far more than 1/6.…”

Section: Induced Fit and Strain Effectsmentioning

confidence: 99%

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Binding Mechanisms in Supramolecular Complexes

2009

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Supramolecular chemistry has expanded dramatically in recent years both in terms of potential applications and in its relevance to analogous biological systems. The formation and function of supramolecular complexes occur through a multiplicity of often difficult to differentiate noncovalent forces. The aim of this Review is to describe the crucial interaction mechanisms in context, and thus classify the entire subject. In most cases, organic host-guest complexes have been selected as examples, but biologically relevant problems are also considered. An understanding and quantification of intermolecular interactions is of importance both for the rational planning of new supramolecular systems, including intelligent materials, as well as for developing new biologically active agents.

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Section: Induced Fit and Strain Effectsmentioning

confidence: 99%

Section: Induced Fit and Strain Effectsmentioning

confidence: 99%

Binding Mechanisms in Supramolecular Complexes

2009

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“…-pentan. [54] Durch den bei der Komplexierung notwendigen Aufbau von gauche-Wechselwirkungen bindet ein offenkettiges Tetramin Kupfer(II)-Ionen um den Faktor 10 10 -mal schwächer als der entsprechende Makrocyclus. [54a] Im Komplex von Kaliumionen mit der Kronenverbindung [18]Krone-5 sind nur 1/6 weniger Sauerstoffatome als potenzielle Akzeptorzentren vorhanden als im Komplex mit [18]Krone-6, jedoch ist die Bindungskonstante mit [18]Krone-6 um weit mehr als 1/6 reduziert: Dies ist das Resultat einer sterischen Hinderung bei Ersatz eines O-Atoms durch eine CH 2 -Gruppe.…”

Section: Induzierte Passform Und Spannungseffekteunclassified

Bindungsmechanismen in supramolekularen Komplexen

Schneider

2009

Angewandte Chemie

185

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Kräfte‐Sammelsurium: Supramolekulare Komplexe, wie der gezeigte, beruhen meist auf einer Kombination unterschiedlichster Wechselwirkungen, wie Ionenpaarbildung, Wasserstoffbrücken und Stapelwechselwirkungen. Die nicht immer einfache Charakterisierung von Natur und Stärke der intermolekularen Kräfte liefert Beiträge zum Verständnis biomimetischer Systeme wie auch zum Design von synthetischen Rezeptoren, Wirkstoffen und intelligenten Materialien. Die supramolekulare Chemie hat in den letzten Jahren eine enorme Ausdehnung erfahren, sowohl mit Blick auf mögliche Anwendungen wie auch auf analoge biologische Systeme. Bildung und Funktion supramolekularer Komplexe werden durch eine Vielzahl von oft schwer zu differenzierenden nichtkovalenten Kräften bestimmt. Ziel dieses Aufsatzes ist es, die entscheidenden Wechselwirkungsmechanismen zusammenhängend darzustellen und das Gesamtgebiet auf diese Weise zu klassifizieren. Als Beispiele werden meist organische Wirt‐Gast‐Komplexe gewählt, unter Berücksichtigung auch von biologisch relevanten Fragestellungen. Das Verständnis und die Quantifizierung der intermolekularen Wechselwirkungen ist für die rationale Planung neuer supramolekularer Systeme, einschließlich intelligenter Materialien, ebenso von Bedeutung wie für die Entwicklung neuer Wirkstoffe.

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“…In order to increase the stability, preorganizing groups have been attached to the carbon backbone of EDTA and DTPA (Brechbiel et al 1986;Wu et al 1997, McMurry et al 1998. Preorganization obviously stabilizes the conformation of the free chelator in a manner which is comparable to the metal chelate (Hancock 1989). The reduction of the entropy, which in general works against the complexation of a metal, leads to faster complexation kinetics.…”

Section: Acyclic Bifunctional Chelatorsmentioning

confidence: 99%