Multimodal visualization of complementary color-coded FA map and tensor glyphs for interactive tractography ROI seeding

Voltoline, Raphael; Wu, Shin-Ting

doi:10.1016/j.cag.2021.03.001

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“… 1 We note that DEC-FA maps are also referred to as FA color maps (Young, 2007), color by orientation maps (Norton et al, 2017), color-coded maps (Schneider et al, 2021), color-coded FA maps ( Voltoline and Wu, 2021 ), and other similar names. …”

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confidence: 99%

Directionally encoded color track density imaging in brain tumor patients: A potential application to neuro-oncology surgical planning

Sullivan

Zekelman

Zhang

et al. 2023

NeuroImage: Clinical

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Directionally encoded color track density imaging in brain tumor patients: A potential application to neuro-oncology surgical planning

Sullivan

Zekelman

Zhang

et al. 2023

NeuroImage: Clinical

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“…Para alcançar este objetivo, desenvolvemos um fluxo de renderização e identificamos quatro sub-problemas: a estimação dos tensores de difusão, a visualização dos tensores estimados, o co-registro entre as imagens de DTI e outras modalidades, e a visualização coregistrada dessas modalidades de dados distintos. Um protótipo da proposta apresentada pode ser obtido em (VOLTOLINE, 2016).…”

Section: Conclusãounclassified

Visualização multimodal de imagens de tensores de difusão

Ramos¹

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Em tecidos vivos fibrosos, como o cérebro, o movimento browniano das moléculas de água tende a ter uma direção preferencial que coincide com a orientação das fibras. Por meio de Imageamento de Ressonância Magnética Ponderado em Difusão ou DWI (Diffusion-weighted Imaging) é possível quantificar de forma não-invasiva essa movimentação em uma determinada direção. A partir de seis ou mais imagens de DWI adquiridas em diferentes direções, o tensor de difusão pode ser estimado através da técnica de Imageamento de Tensor de Difusão ou DTI (Diffusion Tensor Imaging). Informações sobre a difusão da água, como a direção preferencial, podem ser recuperadas do tensor estimado e visualizadas junto com outras modalidades de neuroimagens, viabilizando novos estudos sobre a anatomia da substância branca. Este trabalho tem como objetivo integrar a renderização de imagens de DTI em um ambiente de visualização multimodal interativo. Para estimar a partir dos volumes de DWI os tensores simétricos positivos definidos em diferentes níveis de precisão, nós conduzimos um estudo comparativo entre os algoritmos clássicos de estimação e um novo algoritmo que se supõe apresentar a flexibilidade no controle da precisão. A fim de proporcionar uma visualização da informação de direção principal de difusão em imagens 2D alinhadas com outras imagens escalares, nós propomos um novo mapa de cores que ameniza os problemas presentes nos mapas existentes relacionados à interpretação dos vetores de direção codificados em cores. E, foi desenvolvido um novo algoritmo interativo de renderização multimodal baseado em GPU de glifos de tensor superquádricos junto com um volume anatômico de dados escalares, que propicia ainda mais a percepção tri-dimensional dos tensores e a reconstrução mental da trajetória espacial dos tratos.

show abstract

Accelerating Geometry-Based Spherical Harmonics Glyphs Rendering for dMRI Using Modern OpenGL

Poirier

Descoteaux

Gilet

2021

Computational Diffusion MRI

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Multimodal visualization of complementary color-coded FA map and tensor glyphs for interactive tractography ROI seeding

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Directionally encoded color track density imaging in brain tumor patients: A potential application to neuro-oncology surgical planning

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Visualização multimodal de imagens de tensores de difusão

Accelerating Geometry-Based Spherical Harmonics Glyphs Rendering for dMRI Using Modern OpenGL

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