La problématique de l’intégration des systèmes d’information est maintenant bien connue, même dans le cas spécifique des PME. L’article avance la connaissance des mécanismes d’adoption des systèmes de gestion intégrés (SGI) en se focalisant sur le moment de la sélection finale, qui peut se caractériser par l’arbitrage suivant : choisir un ERP ou bien choisir un système alternatif ? Cet arbitrage, auquel les PME font face, revient à choisir entre deux types de systèmes dont les capacités d’intégration diffèrent. Afin de comprendre les ressorts de ce choix, la recherche mobilise la méthode d’analyse qualitative comparée (QCA) appliquée à seize cas de PME. Suivant un principe d’équifinalité, cette méthode permet de mettre en évidence différentes combinaisons de critères guidant la sélection par la PME d’un ERP ou bien d’un système alternatif. Les configurations multi-critères identifiées soulignent le rôle central de la complexité comparée des systèmes, en tant que condition nécessaire, mais non suffisante au choix du SGI. Les autres critères (adéquation, compatibilité, coût et engagement de l’intégrateur), selon la manière dont ils sont combinés, vont également influencer le choix au moment de la sélection finale. Ces différentes configurations permettent de discuter les ambitions du projet souhaité par les PME, selon la capacité d’intégration retenue et l’objectif transformationnel visé au moment de la sélection. La recherche offre alors un éclairage renouvelé sur les mécanismes de choix en amont du projet, ces mécanismes ayant des répercussions directes sur la suite du projet dans sa phase d’implémentation.