Polygonal peatlands are carbon-rich permafrost ecosystems that will likely be significantly affected by climate change. However, studies are often constrained to one measurement per day, which impedes assessments of the temporal variability in carbon fluxes. For this reason, we measured ecosystem respiration (ER) of CO 2 in a polygonal peatland underlain by continuous permafrost over an entire growing season to determine the effects of temperature and water table depth on the temporal variability of ER. We used four automated closed chambers to measure ER under varying temperature and soil moisture regimes. Temporal variability was approximately the same for the four plots, on both a diurnal and a seasonal scale. Both diurnal and seasonal variations in ER were strongly controlled by changes in soil surface temperature. Fluctuations of the water table depth associated with important rainfall events was also an important factor affecting ER on the seasonal scale. We found that water table level fluctuations below 20-25 cm did not significantly affect ER and that most soil respiration took place in the top 10 cm, likely in the surface 2 cm. Our results highlight the importance of monitoring future changes in tundra hydrology, which will determine the depth of organic matter available for aerobic decomposition.Key words: permafrost, tundra, polygonal peatland, carbon dioxide, water table.Résumé : Les tourbières polygonales sont des écosystèmes de pergélisol riches en carbone qui seront probablement significativement touchés en raison du changement climatique. Cependant, les études sont souvent contraintes à une mesure par jour, ce qui empêche les évaluations de la variabilité temporelle des flux de carbone. C'est pourquoi nous avons mesuré la respiration de l'écosystème (RÉ) au niveau du CO 2 dans une tourbière polygonale chevauchant un pergélisol continu au cours d'une saison de croissance entière dans le but de déterminer les effets de température et de profondeur de nappe phréatique sur la variabilité temporelle de la RÉ. Nous avons utilisé quatre caissons fermés automatisés afin de mesurer la RÉ sous divers régimes de changement de température et d'humidité du sol. La variabilité temporelle était approximativement la même pour les quatre parcelles de terrain, et ce, à l'échelle tant diurne que saisonnière. Les variations tant diurnes que saisonnières de la RÉ étaient fortement liées aux changements de température du sol de surface. Les fluctuations de profondeur de la nappe phréatique associées aux événements pluvieux importants constituaient aussi un facteur important influant sur la RÉ à l'échelle saisonnière. Nous avons constaté que les fluctuations du niveau de la nappe phréatique au-dessous de 20-25 cm n'ont pas eu d'effets significatifs sur la RÉ et que la grande partie