A diferenciação de bactérias causadoras de gastrenterites através de métodos microbiológicos clássicos é muito eficiente, na maior parte dos casos. Todavia, o elevado custo dos reagentes e o tempo necessário para tais determinações, cerca de 4 dias, podem causar sérias conseqüências, quando os pacientes são crianças, idosos ou adultos com baixa resistência imunológica. Assim, a pesquisa por métodos espectroscópicos de baixo custo, que permitam tais determinações com pouco uso de reagentes e em curtos intervalos de tempo é extremamente relevante. Neste trabalho os principais microrganismos causadores de gastrenterites, E. coli, S. chroleraesuis, S. flexneri foram avaliados. Foram preparadas sessenta dispersões para cada um dos microrganismos, usando solução fisiológica como solvente, e seus espectros adquiridos. Os espectros obtidos foram muito similares, tornando muito difícil a diferenciação dos microrganismos. Entretanto, aplicando a teoria de correlação generalizada em 2D, foi possível diferenciar os microrganismos avaliados usando o espectro síncrono como "impressão digital do organismo" em um curto intervalo de tempo (~10h).The discrimination of the bacteria that cause gastroenteritis through classical microbiological methods is very efficient in the great majority of the cases. However, the high cost of chemicals and the time spent for such identifications, about four days, could generate serious consequences for the patients. Thus, the search for low cost spectroscopic methods which would allow a fast and reagentless discrimination of these microorganisms is extremely relevant. In this work the main microorganisms that cause gastroenteritis: E. coli, S. chroleraesuis, S. flexneri were studied. For each of the microorganisms sixty different dispersions were prepared using physiological solution as solvent and its Raman spectra recorded. The 1D spectra obtained were similar, making it very difficult to differentiate the microorganisms. However, applying the 2D correlation method, it was possible to identify the microorganisms evaluated using the synchronous spectrum as "whole-organism fingerprinting" in a reduced time interval (~10 h).