IV 2. ΥΛΙΚΑ ΚΑΙ ΜΕΘΟΔΟΙ 46-72 2.1 ΥΛΙΚΑ 47-49 2.1.1 Πειραματόζωα 47 2.1.2 Αντιδραστήρια 47 2.1.3 Αντισώματα 48 2.2 ΜΕΘΟΔΟΙ 50-72 2.2.1 Προετοιμασία επιδεκτικών βακτηριακών κυττάρων ηλεκτρικού μετασχηματισμού 50 2.2.2 Ηλεκτρικός μετασχηματισμός επιδεκτικών βακτηριακών κυττάρων (Electroporation) 50 2.2.3 Προετοιμασία επιδεκτικών βακτηριακών κυττάρων μετασχηματισμού 51 2.2.4 Μετασχηματισμός επιδεκτικών βακτηριακών κυττάρων 52 2.2.5 Μικρής κλίμακας απομόνωση πλασμιδιακού DNA από βακτηριακές αποικίες (Mini-preps) 52 2.2.6 Απομόνωση πλασμιδιακού DNA σε μεγάλη κλίμακα από βακτήρια και καθαρισμός του με τη μέθοδο CsCl 53 2.2.7 Απομόνωση πλασμιδιακού DNA από βακτηριακές καλλιέργειες μεγάλης κλίμακας (large scale plasmid DNA prep.) με χρήση Qiagen Plasmid Maxi Kit 55 2.2.8 Ηλεκτροφόρηση DNA σε πήκτωμα αγαρόζης 56 2.2.9 Απομόνωση και καθαρισμός DNA από πήκτωμα αγαρόζης 57 2.2.10 Διαμόλυνση κυτταρικών σειρών θηλαστικών σε καλλιέργεια 57 2.2.11 Έμμεσος ανοσοφθορισμός ευκαρυωτικών κυττάρων 58 2.2.12 Απομόνωση πρωτεϊνών από κυτταρικές σειρές θηλαστικών σε καλλιέργεια ή ιστό μυός. 59 2.2.13 Προσδιορισμός συγκέντρωσης πρωτεϊνών 60 V 2.2.14 Πειράματα ανοσοκατακρήμνισης 2.2.15 Ανάλυση πρωτεϊνών κατά Western 2.2.16 Απομάκρυνση αντισωμάτων για την επανάληψη της ανοσοανίχνευσης 2.2.17 Καλλιέργεια νωτιαίων αισθητικών γαγγλίων (DRG explants) 64 2.2.18 Απομόνωση και καλλιέργεια των κυττάρων Schwann 2.2.19 Αποσύνδεση νωτιαίων γαγγλίων 2.2.20 Συγκαλλιέργειες DRG νευρώνων και κυττάρων Schwann 2.2.21 Ανοσοϊστοχημική ανάλυση καλλιεργειών νωτιαίων γαγγλίων 2.2.22 Διαχωρισμός νευρικών ινών και ανοσοϊστοχημική ανάλυση 67 2.2.23 Παρατήρηση, φωτογράφηση, ανασύσταση και ανάλυση εικόνων 2.2.24 Κατασκευές DNA 68-72 • Κατασκευές IgC 2 -GFP και FN III -GFP 68 • PLP κατασκευή • Thy1 κατασκευή 3. ΑΠΟΤΕΛΕΣΜΑΤΑ 73-110 3.1 DNA κατασκευές για την μελέτη των επιμέρους περιοχών της TAG-1 74 3.2 Αλληλεπιδράσεις της TAG-1 και των επιμέρους περιοχών της με τους διαύλους καλίου (Κv) 3.2.1 Η TAG-1 αλληλεπιδρά απευθείας με τους διαύλους καλίου 3.2.2 Μελέτη των αλληλεπιδράσεων μεταξύ των διαύλων καλίου (Κν) και της πρωτεΐνης Caspr2 3.2.3 Οι ανοσοσφαιρινικές περιοχές της TAG-1 αλληλεπιδρούν απευθείας με τους διαύλους καλίου 84 VI 3.2.4 Οι φιμπρονεκτινικές περιοχές της TAG-1 δεν αλληλεπιδρούν απευθείας με τους διαύλους καλίου 87 3.3 Αλληλεπιδράσεις της TAG-1 και των επιμέρους περιοχών της με την πρωτεΐνη Caspr2 88 3.3.1 Οι ανοσοσφαιρινικές περιοχές της TAG-1 αλληλεπιδρούν απευθείας με την Caspr2 89 3.3.2 Οι φιμπρονεκτινικές περιοχές της TAG-1 δεν αλληλεπιδρούν απευθείας με την Caspr2 92 3.4 Μελέτη των αλληλεπιδράσεων μεταξύ της TAG-1 και της πρωτεΐνης Connexin-29 (Cx29) 94 3.5 DNA κατασκευές για την μοριακή διάσωση του φαινοτύπου των Tag1 -/μυών 97 3.5.1 PLPκατασκευή 98 3.5.2 Thy1 κατασκευή 100 3.6 Μελέτη της έκφρασης της TAG-1 και των αλληλεπιδράσεών της, χρησιμοποιώντας καλλιέργειες νωτιαίων γαγγλίων (Dorsal Root Ganglia: DRG) 101 3.6.1 Διατήρηση του φαινοτύπου των Τag1 -/ζώων σε καλλιέργειες νωτιαίων αισθητικών γαγγλίων και συγκαλλιέργειες Τag1 -/και αγρίου τύπου DR...