Die AS aus Salmonella typhimurium (stAS) ist ein Heterotetramer aus zwei Synthase-und zwei Glutaminaseuntereinheiten (stTrpE bzw.stTrpG).[4] Im aktiven Zentrum der Glutaminase stTrpG wird Glutamin zu Glutamat und naszentem Ammoniak hydrolysiert, wobei letzterer durch einen Kanal zum aktiven Zentrum von stTrpE geleitet wird. [4,5] Um diejenigen Aminosäurereste von stTrpE zu identifizieren, die am intermolekularen Tr ansport ("channeling") des Ammoniaks zwischen den aktiven Zentren beteiligt sind und deshalb in Kontakt zu diesem kommen kçnnen, wurde MOLE 2.0 angewendet (ein Programm zur Analyse von makromolekularen Tu nneln und Kanälen).[6] Zwischen den aktiven Zentren des stAS-Komplexes konnten wir einen 30 l angen Kanal lokalisieren (Abbildung 2a), der dem Kanal ähnelt, der in der Kristallstruktur der zur AS homologen Aminodeoxyisochorismatsynthase PhzE beobachtet worden ist.[7] Nahe des CHLiganden wird der Kanal hauptsächlich von drei Aminosäu-reresten gebildet:D ies sind Gln263 in b-Strang 11 sowie Met364 und Leu365 in a-Helix 12. Um abzuschätzen, inwieweit die Aminosäuren an diesen Positionen mit der Nukleophilspezifität von AMEs und WMEs korreliert sind, wurden für die vier MST-Enzymklassen (ADCS,A S, ICS und SS) individuelle multiple Sequenz-Alignments (MSAs) erstellt. Nennenswerterweise bilden die in den MSAs enthaltenen Sequenzen auch in einer phylogenetischen Analyse vier distinkte Teilbäume (Abbildung S1);s ie sind daher repräsenta-tiv für die vier MST-Klassen. Anhand der aus den MSAs abgeleiteten Sequenzlogos für b-Strang 11 und a-Helix 12 (Abbildung 2b)k onnte die bereits früher beschriebene strikte Konservierung von Gln263 in AS und von Lysa nd er entsprechenden Position in ICS und SS [2] bestätigt werden. Dieses Lysnimmt in ICS und SS die Rolle einer katalytischen Base zur Aktivierung von Wasser ein. [2,8] In einer gewissen Zahl von ADCS-Sequenzen ist Gln263 durch Glu ersetzt. Interessanterweise sind die Aminosäuren an den Positionen 364 und 365 jeweils innerhalb der AMEs und WMEs stark konserviert, unterscheiden sich aber gleichzeitig zwischen diesen beiden Gruppen. Innerhalb der AMEs ist Met364 strikt konserviert, genauso wie Leu365 in AS und Ile365 in ADCS.InWMEs ist Position 364 hingegen weitestgehend mit hydrophoben Aminosäuren (Leu, Ile,P he,V al) besetzt;P o-