A técnica MIMS (membrane introduction mass spectrometry) foi utilizada para monitorar a formação de clorofórmio durante a cloração de suspensões aquosas de várias espécies brasileiras de algas verdes e azuis (Microcystis panniformis, Selenastrum sp., Scenedesmus sp., Monoraphidium sp. (strain 354), Monoraphidium sp. (strain 960), and Staurastrum sp.). Foram avaliadas as influências de parâmetros como temperatura, pH, concentração inicial de hipoclorito de sódio, filtração e tempo de reação. Foi constatado que o teor de clorofórmio é fortemente dependente da espécie de alga e também é favorecido com o aumento da temperatura, pH, dosagem de cloro inicial e do tempo de reação. Amostras de suspensões de algas submetidas a filtração produziram menores quantidades de clorofórmio em comparação com as amostras brutas.Membrane introduction mass spectrometry (MIMS) was used to perform on-line monitoring of the chloroform formation via the chlorination of aqueous suspensions of several green and blue-green Brazilian algae (Microcystis panniformis, Selenastrum sp., Scenedesmus sp., Monoraphidium sp. (strain 354), Monoraphidium sp. (strain 960), and Staurastrum sp.). The influence of major parameters, such as temperature, pH, initial concentration of sodium hypochloride, filtration, and reaction time, on chloroform formation was evaluated. It was verified that the chloroform formation is strongly dependent on the alga type and is favored by high temperatures, pH, sodium hypochloride initial concentration and reaction time. Finally, filtered algae samples produce smaller amounts of chloroform in comparison to the rough suspension.