A pesquisa descreve o distúrbio da depressão e a sua relação com a microbiota intestinal humana, o que leva o indivíduo a estar em disbiose e a sua associação com a patologia. Neste contexto, foi possível enfatizar a importância do tratamento nutricional para esses casos. Como metodologia realizou-se uma pesquisa de revisão bibliográfica, qualitativa e descritiva. A busca das informações científicas disponíveis na literatura ocorreu nas bases de dados eletrônicas Scielo, Google Acadêmico e Pubmed. Foram pesquisados artigos que abordam doenças do foro mental com a microbiota humana, levando em consideração o que de tão eminente pode ocorrer na modulação intestinal e que possa acarretar doenças psíquicas como a depressão, e, por consequência, os danos que os tratamentos com antidepressivos trazem para nossa modulação intestinal, publicados entre os anos de 1997 a 2019, nas línguas portuguesa e inglesa. O diagnóstico da depressão tem origem através de muitas variáveis, porém através desta pesquisa é possível identificar um de tantos motivos para tal patologia, como a disbiose intestinal causada pela má alimentação, uso de fármacos para tratar a mesma patologia e a permeabilidade inadequada desse trato gastrointestinal. A nutrição tem papel fundamental nesses casos, tanto para a prevenção de patologias e distúrbios psíquicos como a depressão, e também para o auxílio no seu tratamento junto a especialista como psicólogos e psiquiatras, mesmo sabendo da importância da nutrição no tratamento e prevenção da depressão, ainda é muito pouco falado sobre esse tipo de auxílio, a mudança de hábitos como a alimentação.