Este artigo teve como objetivo analisar os impactos e desafios impostos pela pandemia da COVID-19 no desempenho das atividades e ações das Unidades de Conservação (UC’s) e Organizações Não Governamentais (ONG’s) que atuam na conservação e preservação do meio ambiente na cidade de Caravelas, Bahia. A pesquisa se deu em função da necessidade da análise e compreensão de como essas instituições e seus profissionais estão conduzindo seus trabalhos durante esse período pandêmico e quais seriam as maiores dificuldades enfrentadas do ponto de vista ambiental. Como instrumento principal, foi utilizado a plataforma Google Forms para o envio do questionário. Participaram desta pesquisa 07 instituições. As instituições foram abordadas com um questionário qualiquantitativo, acerca das dificuldades de manter o funcionamento dessas mesmas instituições em período pandêmico e entender as limitações e os impactos que a pandemia do novo coronavírus (SARS-Cov-2) trouxe e de que forma as instituições puderam se inovar nesse momento. Portanto, em relação aos problemas ambientais, 28% dos respondentes acreditam que houve impactos negativos, 28% responderam que ainda é cedo para afirmar sobre o agravamento e 44% relataram que a pandemia não agravou os problemas, apenas os mantiveram. Todavia, verificou-se que em decorrência da pandemia, houve desemprego, fechamento de escritório, atividades de campo paralisadas e cancelamento de eventos. Evidencia-se a necessidade de acompanhamento contínuo nas UC’s e ONG’s ambientalistas de Caravelas, no contexto de transição do remoto para a volta ao presencial, com adoção de estratégias de construção participativa entre o terceiro setor, setor público e sociedade civil.