Phát hiện và xác định loài của Cryptosporidium bằng phương pháp miễn dịch huỳnh quang (IFA) và PCR giải trình tự từ mẫu chất thải biogas tại tỉnh Bắc Giang

Abstract

Mục tiêu của nghiên cứu này là nhằm đánh giá sự khác nhau và hiệu quả của phương pháp IFA và PCR giải trình tự trong việc xác định sự hiện diện và định danh ở mức độ loài của Cryptosporidium spp. trong mẫu chất thải biogas. Trong nghiên cứu này, 167 mẫu chất thải biogas được thu thập từ 03 huyện (Việt Yên, Lạng Giang và Hiệp Hòa) của tỉnh Bắc Giang từ năm 2019 - 2020 để tìm bào nang Cryptosporidium. Có 16 trong số 167 (9,6%) mẫu được phân tích bằng phương pháp miễn dịch huỳnh quang (IFA) dương tính với Cryptosporidium spp.,. Trong số này 11 mẫu đồng thời được khẳng định dương tính với Cryptosporidium spp., bằng phương pháp PCR. Các mẫu dương tính với PCR được giải trình tự trên gen 18S rRNA. Cụ thể, có 4 loài Cryptosporidium scrofarum, 2 C. suis được phát hiện trong mẫu nước thải trước biogas. Có 2 loài C. scrofarum, 1 C. suis, 1 C. bailey và 1 C. meleagridis được phát hiện trong mẫu nước thải sau biogas. Kết quả PCR giải trình tự cho thấy các loài Cryptosporidium phân lập được là những loài lây truyền từ động vật sang người. Chính vì vậy, việc xác định Cryptosporidium spp. bằng phương pháp miễn dịch huỳnh quang, kết hợp với PCR giải trình tự gen 18S rRNA có ý nghĩa quan trọng trong các nghiên cứu dịch tễ học, điều tra nguồn gốc của nhiễm trùng và giám sát bệnh tiêu chảy do Cryptosporidium.