Phylogenetic Relationships of Oryzomine Rodents (Muroidea: Sigmodontinae): Separate and Combined Analyses of Morphological and Molecular Data

Abstract

In this study I provide a phylogenetic hypothesis for the tribe Oryzomyini that can be used to understand the diversification and evolution of this group of rodents and to revise the current generic-level classification. Morphological and molecular data were used for these purposes in combined and separate analyses. Molecular data consisted of partial sequences (1266 bp) from the first exon of the nuclear gene encoding the interphotoreceptor retinoid binding protein (IRBP); the morphological matrix comprised 99 characters, including 16 integumental characters, 32 skull characters, 29 dental characters, 7 postcranial characters, and 10 characters from the phallus and soft-anatomy systems. I present anatomical descriptions for each character, including delineation of different states observed among oryzomyines. Results of the combined analysis were congruent with the IRBP-only dataset for oryzomyine higher-level relationships. Morphological analyses, although showing discrepancies from the combined or IRBP consensus cladograms and with low nodal support values, recovered several clades similar to the combined and IRBP analyses. Systematics of the tribe and the evolution of a few pivotal characters are discussed in light of the proposed phylogeny. Different taxonomic arrangements for species currently included in the genus Oryzomys are suggested. Finally, I evaluate evolutionary and biogeographic hypotheses that are compatible with our current knowledge on oryzomyine relationships.

Anatomia comparada e morfometria de oligoryzomys nigripes e o. flavescens (rodentia, sigmodontinae) no Rio Grande do Sul, Brasil

“…As variações do esqueleto pós craniano em roedores da tribo Sigmodontinae é pouco explorado na literatura. Apesar de algumas exceções para determinadas estruturas e grupos, (e.g., Voss, 1988;Steppan, 1995;Luna & Patterson, 2003;Weksler, 2006), tal escassez de informações impossibilita especular sobre o quanto a variedade da morfologia pós craniana descrita para as duas espécies representam questões ligadas à história natural e suas relações ecológicas. Mesmo assim, as variações nas formas encontradas chamam a atenção para diversas estruturas que podem ser utilizadas em trabalhos futuros, originando novas hipó-teses e marcadores para reconstruções filogenéticas.…”

“…acumulando, recentemente, novas revisões e descrições de espécies (Emmons & Patton, 2005;Weksler, 2006;Weksler et al, 2006, Percequillo et al, 2008Carleton & Arroyo-Cabrales, 2009;Paresque, 2010).…”

Patrones de distribución geográfica de la riqueza de especies de roedores de la tribu Oryzomyini (Rodentia: Sigmodontinae) en Sudamérica: Evaluando la importancia de los procesos de colonización y extinción

“…Sin embargo, se desconocen los mecanismos que dan cuenta de este gradiente latitudinal en la riqueza de especies de la tribu Oryzomyini. Aunque es posible encontrar una gran variedad de estudios realizados en esta tribu con distintos propósitos, principalmente con respecto a su sistemática, taxonomía y biogeografía (e.g., Reig 1984, Gallardo & Palma 1990, Engel et al 1998, Pardiñas et al 2004, Pardiñas & Teta 2005, Weksler 2006, Almeida et al 2007, Percequillo et al 2011. Si bien la mayoría de los estudios actuales se han centrado en esclarecer la monofi lia y composición de la tribu (Voss & Carletton 1993, Steppan 1995, Weksler 2003, relaciones filogenéticas de los nodos internos (Carletton & Olsson 1999, Smith & Patton 1999, Bonvicino & Moreira 2001, Weksler 2003, Voss & Weksler 2009), delineación de gr upos de géneros (Voss & Carletton 1993, Voss et al 2002) y descripción de fósiles (Carletton & Olsson 1999, Pardiñas 2008, Turvey et al 2010, Zijlstra et al 2010, estos no han asociado la biodiversidad obser vada de forma explícita en un contexto geográfi co. Ruggiero et al (1998) a través del estudio de mamíferos sudamericanos, plantean la impor tancia de considerar la estr uctura biogeográfica en análisis de gradientes de distribución de especies, destacando la extensa cordillera de los Andes como estructurador de su distribución.…”

“…Si bien la mayoría de los estudios actuales se han centrado en esclarecer la monofi lia y composición de la tribu (Voss & Carletton 1993, Steppan 1995, Weksler 2003, relaciones filogenéticas de los nodos internos (Carletton & Olsson 1999, Smith & Patton 1999, Bonvicino & Moreira 2001, Weksler 2003, Voss & Weksler 2009), delineación de gr upos de géneros (Voss & Carletton 1993, Voss et al 2002) y descripción de fósiles (Carletton & Olsson 1999, Pardiñas 2008, Turvey et al 2010, Zijlstra et al 2010, estos no han asociado la biodiversidad obser vada de forma explícita en un contexto geográfi co. Ruggiero et al (1998) a través del estudio de mamíferos sudamericanos, plantean la impor tancia de considerar la estr uctura biogeográfica en análisis de gradientes de distribución de especies, destacando la extensa cordillera de los Andes como estructurador de su distribución. Par ticularmente, para Sigmodontinos Pardiñas & Teta (2005), analizan el efecto de las barreras geográfi cas, siendo la formación de los Andes de gran importancia para los procesos de especiación de estos roedores (Reig 1980, 1984, Weksler 2006.…”

“…De acuerdo a esta hipótesis, habría ocurrido un intercambio de individuos entre metacomunidades de la Amazonia como hábitat fuente (zona óptima) y los nuevos ambientes colonizados hacia el sur y nor te de Sudamérica como hábitat sumider o (zonas subóptimas). De este modo, los ancestros de la Amazonia habrían diversificado en Sudamérica a través de un proceso de colonización y extinción, en el cual la cordillera fue uno de los principales ejes de dispersión (Reig 1984, Weksler 2006. En este proceso, especies ancestrales colonizar on nuevas ár eas geográficas, ampliando sus rangos de distribución llegando a ambientes favorables o zonas óptimas (hábitat fuentes) que permitieron su persistencia, y a zonas subóptimas (hábitat sumideros) donde potencialmente se extinguieron o diversifi caron por adaptación local.…”