Phylogenomic analysis of Anabaenopsis elenkinii (Nostocales, Cyanobacteria)

Delbaje, Endrews; Andreote, Ana Paula Dini; Pellegrinetti, Thierry A.; Cruz, Renata Beatriz; Branco, Luis Henrique Zanini; Fiore, Marli Fátima

doi:10.1099/ijsem.0.004648

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“…Bacteria growth over the surface of H. branconii CENA392 trichomes were reduced by serial washing (as reported by Delbaje et al 2021). Total gDNA was extracted from these washed cells using an All-Prep DNA/RNA Mini kit (Qiagen) according to manufacturer's instructions.…”

Section: Genome Sequencing and Assemblymentioning

confidence: 99%

Environmental adaptations by the intertidal Antarctic cyanobacterium Halotia branconiiCENA392 as revealed using long‐read genome sequencing

Dextro

Delbaje

Freitas

et al. 2023

Limnol Oceanogr Letters

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Antarctica poses numerous challenges to life such as cold shock, low nutrient concentrations, and periodic desiccation over a wide range of extreme temperatures. Cyanobacteria survive this harsh environment having evolved adaptive metabolic plasticity to become the dominant primary producers. The type strain cyanobacterium Halotia branconii CENA392 was isolated from an Antarctic intertidal seashore. The complete circular genome of this strain is presented herein, which was assembled using long‐sequence reads. The genome encoded some stress‐related genes associated with low‐temperature adaptation and biosynthesis of mycosporine‐like amino acid (MAA) photoprotective compounds. Empirical experimentation demonstrated constitutive production of the MAA porphyra‐334 and total carotenoids without exposure to low temperatures or ultraviolet radiation stress. Phylogenetic analysis provided insights on taxonomic placement and evolutionary history of some annotated genes. These data exemplify the importance of generating complete quality genome sequences of microorganisms isolated from extreme intertidal environments, facilitating in‐depth evaluation of ecological and taxonomic inferences.

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Section: Genome Sequencing and Assemblymentioning

confidence: 99%

Environmental adaptations by the intertidal Antarctic cyanobacterium Halotia branconiiCENA392 as revealed using long‐read genome sequencing

Dextro

Delbaje

Freitas

et al. 2023

Limnol Oceanogr Letters

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“…Until recently, there is no published information on the morphology and ecophysiology of CENA651; although, our analysis under the microscopy identified this strain as A. elenkinii as well, mainly differing from CCIBt3563 by sampling location at the Nhecolândia Pantanal (Delbaje et al, 2021).…”

Section: Discussionmentioning

confidence: 65%

Oxic methane production by cyanobacteria from the Brazilian Pantanal soda lakes

Carvalho¹

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I would like to acknowledge the sponsorship agencies that financially supported the development of my doctorate project. CNPq for my doctoral scholarship (Process N.: 140384/2018-9), CAPES for the PDSE scholarship during my abroad internship (Process N.:88887.588463/2020-00), FEALQ for supporting the last months of my studies (N. 90360), and FAPESP for the thematic project "Climate change and environmental impacts in wetlands (soda lakes) of the Pantanal (Brazil): quantification, control factors, and long-term forecast" (Process N.: 2016/14227-5).With great esteem, I would like to thank my doctoral supervisor Prof. Dr. Marli Fiore for all the support and supervision during these four years of working together. Thank you for having me in your group and for opening a space for me and this unconventional project, it was a time of great learning that will come with me to my next journeys.In tandem, I want to thank the 'Cyanos' group from the Laboratory of Cellular and Molecular Biology. I hope we can meet again in academia and life. Special gratitude to the lab technicians, Dr. Ana Paula Dini Andreote and Me. Renata Beatriz da Cruz for all the help, cues, and advice they kindly shared with us. From the ones who welcomed me,

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“…A caracterização morfológica e filogenética de alguns isolados de Anabaenopsis elenkinii das lagoas do pantanal foi recentemente relatada contribuindo para a melhor descrição deste gênero (Santos et al, 2018;Delbaje et al, 2021).…”

Section: Potencial Biotecnológico Nas Lagoas Salinas Do Pantanalunclassified

Biossíntese de metabólitos fotoprotetores em cianobactérias isoladas do Pantanal brasileiro

Dextro

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Cleide, por todo o apoio e aprendizado. Um agradecimento especial para a secretária Soninha e todo o apoio dos diretores do CENA (Professores Bendassolli e Ernani) aos eventos discentes que propus ao longo do doutorado. Aproveito para deixar meu muito obrigado a Silvana, Lia, Marília e demais funcionários do CENA que ao longo desses anos desenvolveram comigo relações de amizade e trabalho. Agradeço aos professores do CENA e ESALQ com os quais tive o privilégio de conviver, seja durante aulas, reuniões de comissões ou eventos. Agradeço aos demais colegas pós-graduandos que durante minha vivência no CENA construíram comigo diversos eventos através da APG, como o Webinar e o Simpósio Científicos do CENA e os projetos de extensão CENA na Praça, Feira USP de Profissões e CENA na Escola. Na reta final de meu doutorado tive a oportunidade de passar um semestre na King's College em Londres, onde fui supervisionado pelo Prof. Paul F. Long. I would like to thanks Prof. Paul for all of his assistance and guidance, navigating my professional development and improving my academic writing skills. I am very grateful for this amazing experience abroad and to all the colleagues I met in London. Esta oportunidade única não teria sido possível sem o financiamento advindo da CAPES através de seu Programa Institucional de Internacionalização (PrInt), a quem eu sou extremamente grato.Agradeço ainda à minha família e diversos amigos, em especial meus pais Vera e Osvaldo e minha prima Varinha, que me apoiam e me motivam através de seu amor. Na pós-graduação, por vezes esquecemos da importância de nutrir nossas relações pessoais fora do ambiente acadêmico. Contudo, isso é essencial para que nossa pesquisa seja desenvolvida da melhor maneira possível, com cuidado e atenção, aliada à uma vida feliz e com significado! Sou grato a Kamila, Bruno, Marielle, Jaqueline, Carol, Lisandra, Marcelle, aos meus sogros Rosine e Márcio, Carla, Carolina, Victor, Amanda e a todos os demais amigos que em algum momento destes quatro anos interagiram comigo e estiveram presentes, mesmo que fisicamente distantes.Por fim, se por um lado o apoio técnico-cientifico é essencial para a conclusão de um projeto de doutorado, por outro, o apoio emocional para manutenção da saúde mental engloba tanto aspectos profissionais quanto pessoais, permitindo que tudo o que façamos, inclusive um projeto de doutorado, seja feito com dedicação e orgulho. E, por isso, meu maior agradecimento vai para meu marido Rafael Dantas Barbosa, que é meu parceiro de vida, sempre pronto a me ouvir diante das dificuldades cotidianas, me aconselhar e me amar, independente de meus tropeços e acertos.

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Phylogenomic analysis of Anabaenopsis elenkinii (Nostocales, Cyanobacteria)

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Environmental adaptations by the intertidal Antarctic cyanobacterium Halotia branconiiCENA392 as revealed using long‐read genome sequencing

Environmental adaptations by the intertidal Antarctic cyanobacterium Halotia branconiiCENA392 as revealed using long‐read genome sequencing

Oxic methane production by cyanobacteria from the Brazilian Pantanal soda lakes

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