Phylogeny and temporal diversification of Calomys (Rodentia, Sigmodontinae): Implications for the biogeography of an endemic genus of the open/dry biomes of South America

Almeida, Francisca Cunha; Bonvicino, Cibele Rodrigues; Cordeiro‐Estrela, Pedro

doi:10.1016/j.ympev.2006.07.005

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“…The distribution of this species in Rio de Janeiro is therefore poorly known. Calomys tener and C. expulsus are sympatric in Cerrado, whereas C. cerqueirai inhabits semideciduous forest patches of the Atlantic Forest (Almeida et al 2007). Here, the syntopy between C. tener and C. cerqueirai is recorded for the first time in the Atlantic Forest of Rio de Janeiro.…”

Section: Discussionmentioning

confidence: 67%

“…Aust., 20(3): 492-500, 2016 Calomys tener occurs mainly in the Brazilian Cerrado, but also in transitional areas with Atlantic Forest (Almeida et al 2007) in the states of Bahia, Mato Grosso, Minas Gerais, Rio Grande do Sul, São Paulo and Tocantins (Patton et al 2015). In this study, we captured C. tener in the municipalities of Varresai and Cambuci.…”

Section: Discussionmentioning

confidence: 99%

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A Survey of Small Mammals in the Atlantic Forest of the Northwestern Region of Rio De Janeiro State

Gonçalves-Oliveira¹,

Teixeira

Olifiers³

et al. 2016

Oecol. Austr.

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Small mammals (marsupials and rodents) are one of the most diverse groups of Atlantic Forest mammals, representing 40% of the total diversity of mammals in this biome. Some regions, such as northwestern Rio de Janeiro State, have gaps in mammal inventories. Therefore, we performed small mammal inventories in four fragmented landscapes in the northwestern Rio de Janeiro State using live traps and camera traps. Capture transects were placed both in forest fragments and the altered matrix. We captured six species of marsupials, six Sigmodontinae rodents and one echimyid rodent. The small mammal fauna recorded in this study was composed predominantly of typical Atlantic Forest species, with four endemic species. Furthermore, we obtained the first record of Calomys cerqueirai in the Atlantic Forest of Rio de Janeiro State as well as its syntopy with C. tener. These findings expand the reported geographic distribution of both species.

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Section: Discussionmentioning

confidence: 67%

Section: Discussionmentioning

confidence: 99%

A Survey of Small Mammals in the Atlantic Forest of the Northwestern Region of Rio De Janeiro State

Gonçalves-Oliveira¹,

Teixeira

Olifiers³

et al. 2016

Oecol. Austr.

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“…Portanto, as flutuações climáticas pleistocênicas podem ter contribuído para a origem de uma parcela da diversidade neotropical (Rull, 2008), influenciando na diferenciação populacional de espécies associadas à vegetação xerófita nos períodos interglaciais (Wuster et al 2005, Almeida et al 2007), e à vegetação mesófila nos períodos glaciais (Carnaval & Bates, 2007).…”

Section: Os Genes Transfomer E Periodunclassified

“…Estimativas recentes de tempo de divergência, a partir de análises de relógio molecular, indicam que um número pequeno de táxons se diversificou neste período (Costa, 2003;Moritz et al 2000;Pennington et al 2000, Pennington et al 2005Almeida et al 2007 (Webb, 1978).…”

Section: Os Genes Transfomer E Periodunclassified

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Filogenia do Complexo Drosophila Buzzatii (Grupo Repleta): Inferências de Análises Multilocus Mitocondriais e Nucleares.

Ferreira¹

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Filogenia do complexoOrientador: Prof a . Dr a . Maura Helena Manfrin RIBEIRÃO PRETO 2011Autorizo a reprodução total ou parcial deste trabalho para fins de estudo, desde que citada a fonte. Dedico à minha companheira Caroline, com amor. FICHA CATALOGRÁFICA AGRADECIMENTOSEm especial à Prof a . Dr a . Maura Helena Manfrin (FFCLRP/USP), por ter confiado em meu potencial e me orientado de forma tão prestativa e paciente. Obrigado por todos os ensinamentos, pela motivação e, principalmente, pela amizade.Ao Prof. Dr. Fábio de Melo Sene (FMRP/USP), por todos os ensinamentos, idéias, discussões e, principalmente, pelas histórias compartilhadas nos cafés do laboratório.Ao Prof. Dr. Reinaldo O. A. A. de Brito (UFSCar), pela ajuda com o alinhamento das sequências e sugestões.Ao Prof. Dr. Iderval da Silva Junior Sobrinho (UFSCar), pelas discussões sobre estatística e seleção.Aos professores da banca examinadora, pela disponibilidade em analisar este trabalho.Às amigas Carla Bruniera e Dr a . Érica Cristina de Carvalho, pela fundamental ajuda nas análises filogenéticas.Aos amigos do laboratório, Paulo Epifânio, Mateus Henrique, Luís Bizzo, Camila Kokudai, Cintia Graziela, Gislaine Rodrigues e Taís Lavagnini, por estarem sempre dispostos a me ajudar e por tornarem a convivência no laboratório tão agradável. Ao Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq), pela bolsa de mestrado. À CAPES, FINEP, FAPESP, CNPq e USP que fornecem verbas para a manutenção do Laboratório de Genética Evolutiva.Ao Departamento de Genética da FMRP/USP, pela disponibilização de recursos.À toda a minha família, em especial aos meus pais, Manoel Ferreira Dionísio Jr.e Rosimeiry Ap. Fransak Davanso, ao meu padrasto, Carlos Roberto Davanso, e aos meus avós, Narciso Fransak, Olga Alves Fransak e Elza Peroni, por toda dedicação e por terem sempre me incentivado e investido em minha formação.À minha querida companheira Caroline dos Santos Rodrigues, pela paciência, carinho, apoio e dedicação. et al. 1996). Tal abordagem é essencial para o entendimento das relações filogenéticas, especialmente entre espécies de divergência recente, nas quais existe pouca divergência morfológica e genética, possibilitando a análise dos processos microevolutivos pelos quais a diversidade biológica é gerada em eventos de especiação (Machado & Hey, 2003). O complexo Drosophila buzzatiiO gênero Drosophila é dividido hierarquicamente em "subgêneros", "grupos", "subgrupos", "complexos" e "clusters" de espécies. Embora não reconhecida pelo Código Internacional de Nomenclatura Zoológica, essa classificação é amplamente utilizada em estudos envolvendo espécies desse gênero (Bächli, 2010 Marcadores molecularesAnálises usando múltiplas fontes de informação têm se multiplicado em estudos de evolução. Uma das razões para este fato é que quanto mais aprendemos sobre o processo evolutivo, torna-se evidente que diferentes conjuntos de dados não são equivalentes (Huelsenbeck et al. 1996;Avise, 2009 .1. Citocromo oxidase I e IIO DNA mitocondrial apresenta muitas carac...

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Comparative phylogeography of mainland and insular species of Neotropical molossid bats (Molossus)

Loureiro

Engstrom

Lim

2019

Ecology and Evolution

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Historical events, habitat preferences, and geographic barriers might result in distinct genetic patterns in insular versus mainland populations. Comparison between these two biogeographic systems provides an opportunity to investigate the relative role of isolation in phylogeographic patterns and to elucidate the importance of evolution and demographic history in population structure. Herein, we use a genotype‐by‐sequencing approach (GBS) to explore population structure within three species of mastiff bats (Molossus molossus, M. coibensis, and M. milleri), which represent different ecological histories and geographical distributions in the genus. We tested the hypotheses that oceanic straits serve as barriers to dispersal in Caribbean bats and that isolated island populations are more likely to experience genetic drift and bottlenecks in comparison with highly connected ones, thus leading to different phylogeographic patterns. We show that population structures vary according to general habitat preferences, levels of population isolation, and historical fluctuations in climate. In our dataset, mainland geographic barriers played only a small role in isolation of lineages. However, oceanic straits posed a partial barrier to the dispersal for some populations within some species (M. milleri), but do not seem to disrupt gene flow in others (M. molossus). Lineages on distant islands undergo genetic bottlenecks more frequently than island lineages closer to the mainland, which have a greater exchange of haplotypes.

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Phylogeny and temporal diversification of Calomys (Rodentia, Sigmodontinae): Implications for the biogeography of an endemic genus of the open/dry biomes of South America

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A Survey of Small Mammals in the Atlantic Forest of the Northwestern Region of Rio De Janeiro State

A Survey of Small Mammals in the Atlantic Forest of the Northwestern Region of Rio De Janeiro State

Filogenia do Complexo Drosophila Buzzatii (Grupo Repleta): Inferências de Análises Multilocus Mitocondriais e Nucleares.

Comparative phylogeography of mainland and insular species of Neotropical molossid bats (Molossus)

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