Phylogeography and phylodynamics of European genotype 3 hepatitis E virus

Evidence for the presence of autochthonous (locally acquired) cases of acute hepatitis E virus infections in Italy since the 80s

“…A sharp increase of the number of HEV genotype 3 infections was observed between the 1980 and 2005 by skyline plot analysis of databank isolates from Europe and other developed countries [20]. Accordingly, in the present study three out of four autochthonous (locally acquired) acute HEV cases were detected in the more recent group (1985)(1986)(1987)(1988)(1989)(1990)(1991) of nonA-C hepatitis patients.…”

Épidémiologie de l’hépatite E : une maladie (ré) émergente ?

“…Utilisant la propension particulière de l'hépatite E à être létale chez les femmes enceintes, Teo a revu la littérature depuis le XIX e siècle à la recherche d'épidémies d'ictères ayant cette caractéristique particulière [6]. Celles-ci se seraient succédé à partir de L'analyse du gène codant pour la capside (ORF-2) de 208 souches virales de VHE de génotype 3 a montré l'existence de 2 clades distincts, l'un fait exclusivement de sous-types européens (3e et 3f), l'autre fait d'un sous-type européen (3c) et de tous les sous-types asiatiques et nord-américain (3a, 3b, 3d) [7], ayant un ancêtre commun. La reconstruction phylogéographique et temporelle suggère que le VHE de génotype 3 est né en Europe au début du XIX e siècle, a divergé dans ses deux clades principaux dans les années 1890, puis est apparu en Asie au début du XX e siècle et aux États-Unis à partir de l'Asie en 1970.…”

“…La reconstruction phylogéographique et temporelle suggère que le VHE de génotype 3 est né en Europe au début du XIX e siècle, a divergé dans ses deux clades principaux dans les années 1890, puis est apparu en Asie au début du XX e siècle et aux États-Unis à partir de l'Asie en 1970. Le passage de l'Europe à l'Asie pourrait s'être fait par l'intermédiaire de l'exportation de porcs européens vers le Japon autour de 1900, après la levée d'un interdit religieux [7]. L'amélioration de la qualité sanitaire de l'eau au XIX e siècle en Europe a pu exercer une pression écologique négative sur les VHE de génotypes 1 et 2 qui auraient migré vers l'Est, laissant le VHE de génotype 3 à son premier hôte, le porc [6].…”

“…Impact de l'alimentation et de l'environnement Des VHE de génotypes 3 et 4 sont retrouvés chez un nombre croissant d'animaux. Ils ont été successivement détectés chez le cochon en 1997 puis chez le poulet et le daim au début des années 2000 [7][8][9][10]. Plus récemment, le VHE a été observé chez le rat, le sanglier, le singe, la mangouste, le lapin, la truite et la chauve-souris (figure 2) [4].…”

“…L'incidence mondiale de l'infection par le VHE est restée stable jusqu'aux années 1950, puis a brutalement augmenté parallè-lement à celle de la consommation de viande de porc, et à une intensification des techniques d'élevage [7] : le risque de trouver du VHE dans le foie des animaux augmente avec un abattage précoce, le manque d'hygiène au niveau des abattoirs, et l'origine de l'eau de boisson consommée par les animaux. L'augmentation du nombre de cas d'hépatite E aiguë diagnostiqués peut être également liée au fait qu'elle soit plus fréquemment recherchée, et à l'aide de techniques sérologiques et virologiques plus fiables.…”