Polimorfismos de los genes calpaína y calpastatina en el ganado criollo colombiano Hartón del Valle

Abstract

El objetivo del presente trabajo fue caracterizar el polimorfismo de nucleótido simples 316 y 4751 del gen CAPN y 2959 y CAST1 del gen CAST en la raza bovina criolla colombiana Hartón del Valle. Se genotiparon mediante PCR-RFLP 126 individuos para los cuatro loci. Todos los marcadores fueron polimórficos. El genotipo CC del locus CAPN-316 y el heterocigoto en los otros tres loci tuvieron mayor frecuencia. Las frecuencias de los alelos asociados positivamente con calidad de la carne fueron de C= 21.8 ± 17.5% en CAPN-316, C = 48.4 ± 10.1% en CAPN-4751, T = 52.5 ± 11.4% en CAST-1 y A = 65.1 ± 15.5% en CAST-2959. En todo los loci la Ho (0.599 ± 0.248) fue más alta que la He (0.410 ± 0.081) con valores negativos de FIS y FIT y con desviaciones de EHW solo en CAPN-4751. El valor de FST fue de 0.048 (p < 0.05) y el AMOVA mostró que la variación en estos loci se debía en mayor parte a los individuos (97%). Lo anterior puede ser indicativo de que esta raza presenta predisposición genética para la producción de carne con perfiles de calidad.

Evaluación del efecto de los SNPs G530A (calpaína), C357G (calpastatina), G1795A (miopaladina) y G1181A (PPARGC1A) sobre la terneza de carne bovina de una región del Estado de Veracruz, México

“…La μ-calpaína codificada por el gen CAPN1, es la principal enzima involucrada en la terneza de la carne debido a las bajas concentraciones de calcio que se requieren para su activación, dentro de este gen se encuentra el SNP G530A el cual provoca un cambio de adenosina por guanina en el codón 530 (GTC/ ATC), lo que resulta en el intercambio de una valina por isoleucina, esta alteración es relativamente conservada, aunque puede modificar la estabilidad de la proteína y su ensamblaje, lo que podría afectar su actividad proteolítica, por lo que este SNP se ha asociado fuertemente con la terneza (Page et al, 2002;Curi et al, 2009;Soria et al, 2010;Leal et al, 2015). La calpastatina es una enzima inhibidora de la actividad proteolítica de las calpaínas, se codifica por el gen CAST (Motter et al, 2009;Lenis et al, 2018), en donde se han reportado SNPs asociados con la terneza de la carne bovina (Motter et al, 2009;Chung y Davis, 2012;Desgarennes et al, 2017). Sin embargo, hay pocos estudios sobre las variaciones de secuencias o cambios en las regiones reguladoras potenciales que pudieran explicar las diferencias fenotípicas en la calidad de la carne.…”

Parámetros Y Tendencias Genéticas Para Peso Al Nacimiento Y Peso Al Destete en Ganado Hartón Del Valle en Colombia

“…Varios trabajos se han desarrollado en el ganado HDV con el objeto de determinar genes asociados a características en la calidad de la leche, calidad de la carne y resistencia a enfermedades (Rosero, Álvarez y Muñoz, 2011;Hernández, Muñoz y Álvarez, 2015;Bolaños, Hernandez y Álvarez, 2017;Lenis et al, 2018), con resultados interesantes y valiosos aportes para su caracterización. Sin embargo, hasta el momento, dado el volumen limitado de información fenotípica y genealógica registrada y disponible, no ha sido posible la estimación de parámetros genéticos en esta población.…”