O objetivo deste trabalho foi investigar e analisar os desafios associados ao ensino da análise combinatória no ensino superior, aplicando uma sequência didática com anagramas. As sequências didáticas foram elaboradas e aplicadas para alunos do ensino superior do curso de Licenciatura em Ciências: Matemática e Física da Universidade Federal do Amazonas, do Instituto de Saúde e Biotecnologia, localizado em Coari-AM. Escolheu-se o tema Permutação para aplicar as sequências didáticas com os discentes. Os alunos foram orientados a criar anagramas com palavras de sua escolha, explorando as possibilidades de combinações. Na sequência os alunos apresentaram seus resultados aos demais colegas buscando justificar e validar suas respostas, seja por demonstração de cálculos ou esboço dos possíveis resultados. Foi possível observar que alguns alunos conseguiram deduzir o cálculo da permutação simples mesmo sem ter sido apresentada a equação. Também foi observado que quando houve repetição de letras, os alunos não conseguiram deduzir a equação de permutação com repetição, sem a intervenção do professor. De modo geral, observou-se que a aplicação da sequência didática permitiu a socialização em sala de aula e o desenvolvimento dos raciocínios combinatórios em conjunto, ao invés de individualmente. Os resultados demonstram que a aplicação da sequência didática colaborou para a reflexão do conteúdo, bem como se apresenta como uma prática alternativa para os métodos de ensino de Análise Combinatória no Ensino Superior, podendo ser estendida para o nível de Ensino Médio.