Predicting infectivity of Arbuscular Mycorrhizal fungi from soil variables using Generalized Additive Models and Generalized Linear Models

Abstract

Djuuna IAF, Abbott LK, Van Niel K (2010) Predicting infectivity of Arbuscular Mycorrhizal fungi from soil variables using Generalized Additive . The objective of this study was to predict the infectivity of arbuscular mycorrhizal fungi (AM fungi), from field soil based on soil properties and land use history using generalized additive models (GAMs) and generalized linear models (GLMs). A total of 291 soil samples from a farm in Western Australia near Wickepin were collected and used in this study. Nine soil properties, including elevation, pH, EC, total C, total N, P, K, microbial biomass carbon, and soil texture, and land use history of the farm were used as independent variables, while the percentage of root length colonized (%RLC) was used as the dependent variable. GAMs parameterized for the percent of root length colonized suggested skewed quadratic responses to soil pH and microbial biomass carbon; cubic responses to elevation and soil K; and linear responses to soil P, EC and total C. The strength of the relationship between percent root length colonized by AM fungi and environmental variables showed that only elevation, total C and microbial biomass carbon had strong relationships. In general, GAMs and GLMs models confirmed the strong relationship between infectivity of AM fungi (assessed in a glasshouse bioassay for soil collected in summer prior to the first rain of the season) and soil properties.

Comunidades de hongos formadores de micorrizas arbusculares en talares del partido de Magdalena, provincia de Buenos Aires: Interacción con la invasión de <i>Ligustrum lucidum</i>

“…El papel de comunidad vegetal como un factor determinante que condiciona la composición y estructura espacial de la comunidad de hongos micorrícicos arbusculares (HMA) ha sido ampliamente estudiada (Smith & Read, 2008;Djuuna et al, 2010). En general, comunidades de plantas contrastantes en términos de diversidad se asocian con cambios en la diversidad fúngica y se observa una relación positiva entre la riqueza específica de plantas y la de HMA (Hiiesalu et al, 2014).…”

“…Debido a que las distintas especies de plantas difieren en su dinámica de toma de nutrientes, aporte de hojarasca y producción de exudados radicales, los cambios en la comunidad vegetal pueden modificar la disponibilidad de ciertos nutrientes en el suelo y otras propiedades, como el pH y la textura (Weidenhamer & Callaway, 2010). Diversos estudios realizados tanto en ecosistemas naturales como agroecosistemas han analizado la relación entre las características del suelo con la diversidad y esporulación de los HMA (Aliasgharzadeh et al, 2001;Djuuna et al, 2010). En líneas generales, las variables que tienen mayor impacto sobre la comunidad de hongos son la materia orgánica (MO), el fósforo (P) y el nitrógeno (N).…”