A atividade de compreensão do código-fonte é fundamental no desenvolvimento e manutenção de software. Nesse contexto, Átomos de Confusão (AC) surgem como a menor porção de código capaz de causar confusão em desenvolvedores nesse processo. Neste artigo, é apresentado o BOHR - The Atoms of Confusion Hunter, uma ferramenta que tem como objetivos: (i) auxiliar a identificação de AC em sistemas Java; (ii) fornecer relatórios sobre a prevalência desses AC; e (iii) fornecer uma API para o desenvolvimento de novos buscadores customizados para a captura de novos AC e, também, melhorias em suas identificações. Nesta primeira versão, o BOHR é capaz de detectar 8 dos 13 tipos de AC apontados por Langhout e Aniche. Uma avaliação preliminar do BOHR foi conduzida em três sistemas reais, de código aberto, largamente adotados pela comunidade de desenvolvimento de softwares Java (Picasso, greenDAO e Socket.IO-client Java). Os resultados iniciais mostraram que o BOHR conseguiu detectar com precisão os AC existentes nesses sistemas analisados, apontando de forma correta os snippets dos AC, assim como o seu tipo, nome da classe que era pertencente e o número da linha de código de sua ocorrência. No total, foram encontrados 105 AC, sendo 37 no Picasso, 25 no greenDAO e 43 no Socket.IO-client Java.