Os terceiros molares quando desalinhados, podem provocar complicações para o paciente, e na prática oral especialmente no campo cirúrgico e ortodôntico. Esse estudo objetiva analisar alterações na forma e tamanho da estrutura óssea da mandíbula associadas a impactação de terceiros molares a partir da morfometria geométrica. Trata-se de um estudo transversal, realizado com 110 radiografias panorâmicas de pacientes com idade de 18 a 25 anos, atendidos no Módulo de Odontologia da Universidade Estadual do Sudoeste da Bahia. Após obtenção das imagens de radiografias panorâmicas foram realizadas as medições, em seguida a análise generalizada de Procrustes, Função discriminante, validação cruzada e a distância de Mahalanobis. Não houve diferença significativa no tamanho da mandíbula entre os sexos dos grupos com e sem terceiros molares impactado (p>0.05). Para o formato da mandíbula, identificou-se diferenças significativas (p<0.05) entre os grupos. Radiografias panorâmicas de indivíduos com dentes impactados foram classificados corretamente em 67,1 % das vezes, enquanto no grupo controle 52,4%. A distância de Mahalanobis apresentou diferenças significativas (p< 0,05) entre radiografias de indivíduos com e sem terceiros molares impactados. Com base no outline, as radiografias de pacientes com dentes impactados apresentam expansão na região mentual e compressão na região do côndilo da mandíbula. Conclui-se que há alterações no formato da mandíbula, especialmente na região mentual e do côndilo, e isto, pode estar associado a impactação de terceiros molares.