(1) Antecedentes: En las aguas residuales están presentes muchos microorganismos que son patógenos y peligrosos para la salud, entre algunos de los identificados están los virus, bacterias, hongos, protozoos y helmintos, en el proceso de tratamiento de aguas residuales, los trabajadores de estas plantas, podrían estar expuestos a estos patógenos y a problemas graves de salud. (2) El objetivo de este estudio es definir los agentes biológicos, determinar el nivel de riesgo biológico mediante la cuantificación de variables propuestas por el método y analizar la metodología BIOGAVAL, la factibilidad y ventajas de su aplicación. (3) Métodos: Se utiliza la metodología BIOGAVAL que ha sido creada para actividades en las cuales no se manipulan deliberadamente agentes biológicos como es el caso de las Plantas de Tratamiento de Aguas Residuales (PTAR), esta metodología utiliza variables como: determinación de los puestos a evaluar, identificación del agente biológico implicado, cuantificación de las variables determinantes del riesgo, clasificación del daño, vía de transmisión, tasa de incidencia del año anterior, vacunación, frecuencia de realización de tareas de riesgo, medidas higiénicas adoptadas, cálculo del nivel de riesgo biológico, interpretación de los niveles de riesgo biológico. (4) Conclusiones: Se muestra que los agentes microbiológicos peligrosos se originan de vertidos que se descargan de establecimientos y actividades cercanas, para la aplicación se define los siguientes microorganismos: Escherichia Coli, Salmonella spp, Shigella spp y Áscaris Lumbricoides. El nivel del riesgo se determina como Aceptable. La metodología BIOGAVAL se plantea como una alternativa práctica, útil y de bajo costo, se considera factible para la aplicación en actividades sin intención deliberada de manipulación de agentes biológicos frente a métodos cuantitativos de muestreo bacteriológico en aire o superficies, así como en la detección de bioaerosoles.