Os ecossistemas aquáticos apresentam uma grande diversidade de fauna e flora, o que o torna propício para o desenvolvimento e crescimento de uma biota aquática complexa. A utilização de organismos como bioindicadores da qualidade da água são essenciais para estudos de monitoramento ambiental devido ao fato de serem sensíveis às alterações ambientais. O objetivo deste trabalho foi identificar e registrar organismos bioindicadores no rio Araraquara, cujas águas são utilizadas como fonte de abastecimento público para consumo humano do Distrito de Guaraná, Aracruz-ES. Foram monitorados três pontos de amostragem durante o período de março a outubro de 2017 e as amostras de água foram coletadas em pontos localizados antes da captação de água para abastecimento humano, na bomba de captação de água e após o ponto de lançamento da Estação de Tratamento de Esgoto da cidade. Verificou-se a presença de organismos do reino Protista como, Ciliophora (Ciliados) e Euglenophyta (Flagelados), reino Viridiplantae como, Chlorophyta (Algas Verdes), reino Chromalveolata como, Heterokontophyta (Algas) e o reino Animal, sendo eles, Porifera (Esponjas) e Rotifera (Animais microscópicos aquáticos). De acordo com os resultados obtidos, a distribuição dos táxons no local de estudo foi caracterizada pelos índices pluviométricos, evidenciando a ocorrência de todos nos meses chuvosos.