Ce travail contribue au champ d’investigation du métabolisme territorial sous un aspect peu exploré : les vulnérabilités métaboliques des milieux insulaires. Il propose une enquête à partir de l’analyse des flux de matière et d’énergie de l’île de Ndzuwani (Anjouan – Comores), qui vise à dépasser les contraintes liées aux activités informelles et au manque de bases de données statistiques. Nous avons développé une grille d’analyse des vulnérabilités métaboliques, définies comme l’extension des vulnérabilités environnementales aux conséquences sociales et territoriales de la circulation des flux. Ainsi, la compréhension et la spatialisation du métabolisme insulaire nous ont permis d’appréhender les vulnérabilités métaboliques dans leurs dimensions matérielles, environnementales et territoriales. Enfin, les métabolismes insulaires et émergents présentent également des forces qui méritent d’être discutées à l’aune des relations Sud global – Nord global.