Pareiorhaphis nudula é endêmica do Brasil, e está distribuída nas bacias dos rios Araranguá, Tubarão, Mampituba, Maquiné e Três Forquilhas, nos estados de Santa Catarina e Rio Grande do Sul. A espécie é frequente, mas pouco abundante. Como não foram identificadas ameaças significativas que comprometam sua população no futuro próximo, Pareiorhaphis nudula foi categorizada como Menos Preocupante (LC).