Rôle des longs ARN non codants dans le développement normal et pathologique

Mathieu, Eve-Lyne; Belhocine, Mohamed; Dao, Lan T M; Puthier, Denis; Spicuglia, Salvatore

doi:10.1051/medsci/20143008018

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“…Our study found that MARCH7 and MALAT1 regulated each other, indicating that MARCH7 regulated MALAT1 partly by depending on miR-101. LncRNA could regulate the target protein mainly by directly binding to the target protein and posttranscriptional modification through sponge miRNAs [32,33]. MALAT1 interacted with MARCH7 by miR-200a, and MARCH7 regulated ATG7 by competing for miR-200a.…”

Section: Cellular Physiology and Biochemistrymentioning

confidence: 99%

Interaction of E3 Ubiquitin Ligase MARCH7 with Long Noncoding RNA MALAT1 and Autophagy-Related Protein ATG7 Promotes Autophagy and Invasion in Ovarian Cancer

Zhang

Mei

et al. 2018

Cell Physiol Biochem

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Background/Aims: Ubiquitin E3 ligase MARCH7 plays an important role in T cell proliferation and neuronal development. But its role in ovarian cancer remains unclear. This study aimed to investigate the role of Ubiquitin E3 ligase MARCH7 in ovarian cancer. Methods: Real-time PCR, immunohistochemistry and western blotting analysis were performed to determine the expression of MARCH7, MALAT1 and ATG7 in ovarian cancer cell lines and clinical specimens. The role of MARCH7 in maintaining ovarian cancer malignant phenotype was examined by Wound healing assay, Matrigel invasion assays and Mouse orthotopic xenograft model. Luciferase reporter assay, western blot analysis and ChIP assay were used to determine whether MARCH7 activates TGF-β-smad2/3 pathway by interacting with TGFβR2. Results: MARCH7 interacted with MALAT1 by miR-200a (microRNA-200a). MARCH7 may function as a competing endogenous RNA (ceRNA) to regulate the expression of ATG7 by competing with miR-200a. MARCH7 regulated TGF-β-smad2/3 pathway by interacting with TGFβR2. Inhibition of TGF-β-smad2/3 pathway downregulated MARCH7, MALAT1 and ATG7. MiR-200a regulated TGF-β induced autophagy, invasion and metastasis of SKOV3 cells by targeting MARCH7. MARCH7 silencing inhibited autophagy invasion and metastasis of SKOV3 cells both in vitro and in vivo. In contrast, MARCH7 overexpression promoted TGF-β induced autophagy, invasion and metastasis of A2780 cells in vitro by depending on MALAT1 and ATG7. We also found that TGF-β-smad2/3 pathway regulated MARCH7 and ATG7 through MALAT1. Conclusions: These findings suggested that TGFβR2-Smad2/3-MALAT1/MARCH7/ATG7 feedback loop mediated autophagy, migration and invasion in ovarian cancer.

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Section: Cellular Physiology and Biochemistrymentioning

confidence: 99%

Interaction of E3 Ubiquitin Ligase MARCH7 with Long Noncoding RNA MALAT1 and Autophagy-Related Protein ATG7 Promotes Autophagy and Invasion in Ovarian Cancer

Zhang

Mei

et al. 2018

Cell Physiol Biochem

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“…La caractérisation des miARN est donc en plein essor et leur potentiel de biomarqueur, mis en évidence dans le champ de l'oncologie [36,37] (➜), devrait pouvoir s'appliquer à un très large spectre de maladies [16]. L'autre catégorie de IncARN qui a émergé récemment est celle des lncARN, qui interviennent dans la régulation du génome aussi bien au niveau transcriptionnel que post-transcriptionnel [17], et qui ont été [19]. Entre 500 et 700 de ces lncARN ont été identifiés comme régulés dans le tissu ventriculaire de patients insuffisants cardiaques [20].…”

Section: Découverte Des Arn Non Codants Comme Biomarqueurs De L'insufunclassified

Potentiel des ARN non codants comme biomarqueurs dans l’insuffisance cardiaque

Pinet

Bauters

2015

Med Sci (Paris)

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> La prévalence de l'insuffisance cardiaque est estimée à 1-2 % de la population adulte et la mortalité de ces patients demeure élevée. La recherche de nouveaux indicateurs pronostiques, tels que des biomarqueurs circulants, est nécessaire pour identifier les patients à haut risque et instituer des thérapeutiques de recours. Dans la famille des ARN non codants, nous avons choisi de tester la potentialité des ARN longs non codants (lncARN), comme indicateurs de cette pathologie. Nous avons mis en évidence que les taux plasmatiques du lncARN LIPCAR pouvaient prédire la mortalité précoce chez des patients insuffisants cardiaques. La disponibilité de tels marqueurs permettrait d'envisager une prise en charge appropriée et bénéfique des patients. < L'évaluation pronostique fait donc partie intégrante de la prise en charge du patient insuffisant cardiaque. En effet, les patients identifiés à « haut risque » sont éligibles pour les thérapeutiques de recours que sont l'assistance et/ou la transplantation cardiaque. L'évaluation pronostique du patient insuffisant cardiaque fait classiquement appel à plusieurs paramètres parmi lesquels le stade de la maladie selon la classification NYHA (New York Heart Association), la fonction ventriculaire gauche, la fonction ventriculaire droite, le taux de peptide natriurétique de type B (BNP pour brain natriuretic peptide, responsable de l'excrétion de sodium par les reins) et les paramètres issus de l'épreuve d'effort métabolique (pic de VO 2 ) [5,6]. Il persiste toutefois une importante variabilité dans le pronostic de l'insuffisance cardiaque, des patients considérés à faible risque présentant une évolution défavorable, et des patients évalués à haut risque ayant, de manière surprenante, une survie très prolongée. De plus, certains paramètres pronostiques puissants, comme ceux de l'épreuve d'effort métabolique par exemple, ne sont pas toujours disponibles en pratique clinique. Il existe donc un besoin important de nouveaux indicateurs pronostiques dans l'insuffisance cardiaque. Idéalement, il devrait s'agir de marqueurs non invasifs, facilement disponibles, ne dépendant pas de l'opérateur, et relativement peu coûteux. Les biomarqueurs circulants correspondent à ce « cahier des charges ». À l'heure actuelle, le BNP est le seul biomarqueur circulant qui est utilisé en routine dans cette indication [7]. En effet, chez les patients ayant une insuffisance cardiaque systolique stable, la détermination du BNP permet une meilleure information pronostique, indépendante de la fraction d'éjection ou du pic de consommation d'oxygène [8] Les maladies cardiovasculaires sont la principale cause de mortalité dans les pays industrialisés avec 1 900 000 morts dans l'Union européenne entraînant un coût estimé à 196 milliards d'euros [1]. En ce qui concerne l'insuffisance cardiaque (IC), sa prévalence a été estimée à 1-2 % de la population adulte des pays industrialisés et augmente avec l'âge puisqu'elle dépasse 10 % chez les individus âgés de plus de 70 ans [2]. En dépit d'importants progrès thérape...

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“…Par exemple, les ARN ribosomaux et les ARN de transfert assurent des fonctions dans la traduction des ARN messagers ; les petits ARN nucléaires sont impliqués dans la régulation de l'épissage [39], et les microARN inactivent de façon spécifique des ARN messagers. En revanche, il est devenu évident aujourd'hui que la majorité des ARN non codants est constituée d'autres molécules, que l'on appelle longs ARN non codants [1,40]. En effet, les régions du génome que l'on pensait être de grands déserts tranquilles s'affirment comme des régulateurs essentiels de l'expression des gènes, à travers leur capacité à produire de longs ARN non codants.…”

Section: Rôles Des Longs Arn Non Codantsunclassified

Le cœur des ARN non codants

Pedrazzini

2015

Med Sci (Paris)

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> La récente identification des longs ARN non codants et le début de leur caractérisation fonctionnelle dans une variété de tissus constituent des avancées scientifiques majeures. Ces avancées ont permis de comprendre les mécanismes moléculaires contrôlant l'expression des gènes en réponse à des changements environnementaux et dans l'adaptation physiopathologique des organes. En particulier, les longs ARN non codants apparaissent comme d'importants régulateurs épigénétiques régulant le remodelage de la chromatine. Dans le coeur, ces transcrits contrôlent la spécification et la différenciation cellulaires au cours du développement. Par ailleurs, ils participent, chez l'adulte, à l'adaptation au stress hémodynamique faisant suite à un dommage tissulaire. La haute spécificité cellulaire d'expression des longs ARN non codants fait de ces molécules des cibles thérapeutiques et des biomarqueurs extrêmement attractifs. < phénotypiques marquées, alors même que le nombre de gènes codants y est très semblable. Cette simple observation suggère que la complexité biologique tire son origine dans une autre portion du génome. Dans cet univers de séquences non codantes, on trouve notamment les séquences régulatrices, qui permettent l'expression coordonnée des gènes, de manière spécifique dans un organe ou dans une cellule particulière, et qui forment le substrat de la complexité. La création d'un catalogue des régulateurs de l'expression des gènes est nécessaire, non seulement pour mieux comprendre les phénomènes biologiques, mais également l'origine des états pathologiques. Dans ce contexte, le projet ENCODE (Encyclopedia of DNA elements) s'attache depuis une dizaine d'années à annoter systématiquement le génome (voir le site http://www.nature.com/encode/) ; l'objectif principal est d'identifier les éléments fonctionnels. Un élément fonctionnel peut être défini comme une séquence déterminée sur le génome et portant une information spécifique. Par exemple, l'information peut être celle qui permet la production d'un ARN, codant ou non codant. Mais l'élément fonctionnel peut également être défini par la présence d'une « signature protéique » sur l'ADN, telle que la liaison d'un facteur de transcription ou d'autres régulateurs de l'expression. Il peut s'agir aussi d'une modification biochimique de l'ADN ou des histones. Par exemple, la méthylation des cytosines dans les promoteurs des gènes est généralement associée à une répression de l'expression. D'autre part, la méthylation de la lysine 4 de l'histone 3 (H3K4Me3) marque un promoteur, alors que l'acétylation de l'histone 3 sur la lysine 27 (H3K27Ac) marque une séquence amplificatrice (enhancer) activée. L'ensemble de ces modifications complexes sont la base de la régulation épigénétique de l'expression des gènes. Comme on le voit, on s'affranchit d'un modèle linéaire qui stipule que l'une des quelques 20 000 séquences composant la partie codante du génome contient l'information permettant la synthèse d'un ARN messager qui, lui-même, permettra la synthèse Organisation du génome...

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Rôle des longs ARN non codants dans le développement normal et pathologique

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Interaction of E3 Ubiquitin Ligase MARCH7 with Long Noncoding RNA MALAT1 and Autophagy-Related Protein ATG7 Promotes Autophagy and Invasion in Ovarian Cancer

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Potentiel des ARN non codants comme biomarqueurs dans l’insuffisance cardiaque

Le cœur des ARN non codants

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