ROS1 Asp2213Asn polymorphism is not associated with coronary artery disease in a Greek case-control study

Abstract

Background: Rs619203 (Cys2229Ser) and rs529038 (Asp2213Asn) polymorphisms in the ROS1 gene have been studied in relation to myocardial infarction (MI) yielding inconsistent results. We investigated the role of ROS1 rs529038 polymorphism in coronary artery disease (CAD) in Greeks using a case-control study. Methods: Genotyping for rs529038 polymorphism was performed using a multiplex PCR technique in patients with CAD (ns294) and controls (ns311). Logistic regression analysis was used to calculate crude and adjusted odds ratios (ORs). Results: Logistic regression analysis did not show any statistically significant effect of ROS1 polymorphism in the occurrence of CAD (AG vs. AA, OR: 1.08, ps0.635; GG vs. AA, OR: 0.62, ps0.220). Adjustment for confounding factors gave similar results, irrespective of the type of disease (i.e., stable coronary artery disease vs. acute coronary syndrome). Conclusions: Our findings do not support the hypothesis that ROS1 rs529038 polymorphism is an important contributing factor in the etiology of CAD in the Greek population.

Identification of differentially expressed genes and signaling pathways in gestational diabetes mellitus by integrated bioinformatics analysis

“…LGR5 [61], GREM1 [62], GLRA3 [63], NEUROD4 [64], CYP2J2 [65], KCNH6 [66], LBP (lipopolysaccharide binding protein) [67], CXCL14 [68], RGN (regucalcin) [69], NPY2R [70], SERPINB13 [71], WNT5A [72], EDA (ectodysplasin A) [73], HSD11B2 [74], ACVR1C [75], NEUROD1 [76], SLIT2 [77], PPARGC1A [78], IGF1 [79], OSR1 [80], CYP46A1 [81], TLR3 [82], BMP7 [83], SELP (selectin P) [84], HLA-A [85], NOTCH2 [86], LRP1 [87], CLU (clusterin) [88], FCN1 [89], CDKN1A [90], SMAD3 [91], HLA-E [92], PTPRC (protein tyrosine phosphatase receptor type C) [93], MYH9 [94], JAK3 [95], IL6R [96], TIMP1 [97], DOCK8 [98], TNFRSF1B [99], ITGAL (integrin subunit alpha L) [100], CD47 [101], RARA (retinoic acid receptor alpha) [102], DGKD (diacylglycerol kinase delta) [103], PLEK (pleckstrin) [104], PREX1 [105], BSCL2 [106], PANX1 [107], IRF7 [108], NOTCH1 [109], STIM1 [110], TRIM13 [111], LRBA (LPS responsive beige-like anchor protein) [112], CXCR4 [113], MDM4 [114], MYO9B [115] and PDE5A [116] were revealed to be expressed in diabetes mellitus, but these genes might be novel targets for GDM. SIX1 [117], GREM1 [118], GHRHR (growth hormone releasing hormone receptor) [119], GPR37L1 [120], CYP2J2 [121], AQP4 [122], ROS1 [123], LBP (lipopolysaccharide binding protein) [124], SGCD (sarcoglycan delta) [125], CXCL14 [126], RGN (regucalcin) [127], F9 [128], KCND2 [129], AZGP1 [130], HAS2 [131], CNTN4 [132], WNT5A [...…”

Genetic Markers of Metabolic Syndrome and Coronary Atherosclerosis in Yakutia Inhabitants

“…В 2005г были опубликованы результаты 3-этапного исследования, выполненного в США, где была показана ассоциация данного ОНП с ИМ [12]. Но в более поздних работах ассоциации rs619203 с ИБС и ИМ не было найдено [4,13,14]. В российском исследовании, выполненном в Ново-сибирске, была показана ассоциация у носителей генотипа СС с ростом, окружностью бедер, ИМТ, ОХС, ЛВП-ХС и ТГ [3].…”

“…В ряде зарубежных исследований в ходе полногеном-ного анализа были получены ассоциации генетиче-ских маркеров с ИМ, артериальной гипертензией (АГ), нарушениями липидного и углеводного обме-нов, функциональными показателями сердечно-сосудистой системы, антропометрическими данными и другими параметрами [4][5][6][7][8][9][11][12][13][14][15]. Большинство выявленных ассоциаций являются принципиально новыми и необходимо их воспроизведение на отдель-ных российских популяциях с целью выявления этноспецифических генетических факторов предрас-положенности к ССЗ, что имеет важное значение для осуществления целенаправленной и индивидуальной профилактики, диагностики и лечения сердечно-сосудистой патологии.…”