Russian “Successful” Clone B0/W148 of Mycobacterium tuberculosis Beijing Genotype: a Multiplex PCR Assay for Rapid Detection and Global Screening

Mokrousov, Igor; Narvskaya, Olga; Vyazovaya, Anna; Otten, Tatiana; Jiao, Weiwei; Gomes, Lia Lima; Suffys, Philip Noël; Shen, Adong; Vishnevsky, Boris

doi:10.1128/jcm.02001-12

Cited by 54 publications

(44 citation statements)

References 7 publications

Supporting

Mentioning

Contrasting

Unclassified

Order By: Relevance

“…Typically, all Beijing-B0/W148 isolates were drug-resistant (88.2 % were MDR), which agrees with the data obtained earlier [5,14]. This proves the "success" of the Beijing-B0/ W148 sublineage.…”

Section: Discussionsupporting

confidence: 81%

“…tuberculosis population can be divided into a number of major lineages; each lineage is geographically associated [2] and carries certain phylogenetic markers that shape the phenotype of the strain [3]. Members of the Beijing family are the most prevalent lineage in Russia; they are highly transmissible ОРИГИНАЛЬНОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ ЭВОЛЮЦИЯ ИНФЕКЦИЙ [5].…”

mentioning

confidence: 99%

See 1 more Smart Citation

MIRU-VNTR genotyping of clinical isolates of Mycobacterium tuberculosis from Moscow region

Shur¹,

Маслов²,

Bekker³

et al. 2017

Bulletin of RSMU

View full text Add to dashboard Cite

Под воздействием различных селективных факторов (применение антибиотиков, генетический полиморфизм и раз-нообразие иммунных статусов хозяина и др.) возбудитель туберкулеза Mycobacterium tuberculosis постоянно эволю-ционирует. Возникают новые линии и сублинии, характеризующиеся набором значимых и незначимых мутаций. Анализ и мониторинг представленности различных линий и их особенностей является важным для понимания эволюции патогена. В данной работе была использована коллекция из 46 клинических изолятов M. tuberculosis, выделенных в Московcком регионе. Была определена их генотипическая принадлежность к различным линиям и сублиниям ти-пированием по 24 локусам MIRU-VNTR. Было показано преобладание изолятов линии Beijing в коллекции (60,9 %) и изолятов сублинии Beijing-B0/W148 (60,7 % внутри линии Beijing), характеризующихся множественной лекарствен-ной устойчивостью (88,2 % изолятов в данной выборке). Также использованный метод позволил определить один предполагаемый случай смешанной инфекции. MIRU-VNTR GENOTYPING OF MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS CLINICAL ISOLATES FROM MOSCOW REGIONAntibiotic selection pressure, genetic polymorphism as well as diversity of the immune status of the host and other selection factors continuously prompt Mycobacterium tuberculosis, the tuberculosis causative agent, to evolve. Significant or insignificant mutations shape new (sub)lineages of the pathogen whose evolution can be understood only through analyzing and monitoring its genotypic diversity and properties of its lineages. In our study we used a set of 46 M. tuberculosis clinical isolates from Moscow region. The samples were typed using the standard 24-loci MIRU-VNTR technique. Beijing family isolates were shown to prevail in the collection (60.9 %), as well as Beijing-B0/W148 subtype (60.7 % of total Beijing type samples); most of them (88,2 %) were multidrug-resistant resistant. The applied technique allowed us to detect one case of a mixed-strain infection.

show abstract

Section: Discussionsupporting

confidence: 81%

mentioning

confidence: 99%

MIRU-VNTR genotyping of clinical isolates of Mycobacterium tuberculosis from Moscow region

Shur¹,

Маслов²,

Bekker³

et al. 2017

Bulletin of RSMU

View full text Add to dashboard Cite

show abstract

“…Nevertheless, knowledge of the specific locations of these insertion sequences has allowed the design of rapid techniques to identify specific genotypes of the W Beijing strain (8)(9)(10). Another objective of this study was to develop a rapid diagnostic method based on a specific point of insertion of IS6110 to identify M. tuberculosis Zaragoza isolates.…”

Section: Discussionmentioning

confidence: 99%

“…In some cases, when a specific location is detected, it has been used as a target to design a multiplex PCR method that allows rapid strain identification. For example, the IS6110 located within the designated region NTF-1 (Rv3128c to Rv3129), Rv2180c, and Rv2664 to Rv2665 allowed identification of the Wmultidrug-resistant Beijing strain, the GC1237 Beijing strain, and clone B0/W148 Beijing, respectively, to better control the transmission of specific epidemic strains (8)(9)(10).…”

mentioning

confidence: 99%

Global Study of IS 6110 in a Successful Mycobacterium tuberculosis Strain: Clues for Deciphering Its Behavior and for Its Rapid Detection

et al. 2013

View full text Add to dashboard Cite

eThe Mycobacterium tuberculosis insertion sequence IS6110, besides being a very useful tool in molecular epidemiology, seems to have an impact on the biology of bacilli. In the present work, we mapped the 12 points of insertion of IS6110 in the genome of a successful strain named M. tuberculosis Zaragoza (which has been referred to as the MTZ strain). This strain, belonging to principal genetic group 3, caused a large unsuspected tuberculosis outbreak involving 85 patients in Zaragoza, Spain, in 2001 to 2004. The mapping of the points of insertion of IS6110 in the genome of the Zaragoza strain offers clues for a better understanding of the adaptability and virulence of M. tuberculosis. Surprisingly, the presence of one copy of IS6110 was found in Rv2286c, as was recently described for a successful Beijing sublineage. As a result of this analysis, a rapid method for detecting this particular M. tuberculosis strain has been designed.

show abstract

“…Принадлежность к генотипу Beijing определяли по наличию специфической вставки элемента IS6110 в локусе dnaA-dnaN хромосомы методом ПЦР в формате реаль-ного времени [19]. Кластер B0/W148 генотипа Beijing идентифицировали по наличию специ-фической вставки IS6110 в межгенном участ-ке Rv2664-Rv2665 с помощью мультиплексной ПЦР [16]. Генотипирование штаммов других генетических групп (non-Beijing) осуществляли методом сполиготипирования [10].…”

Section: материалы и методыunclassified

Molecular Epidemiology of Tuberculosis in the Kaliningrad Region of Russia: 10 Years After

Вязовая

Akhmedova²,

Соловьева

et al. 2018

Russian Journal of Infection and Immunity

View full text Add to dashboard Cite

Резюме. В Калининградской области за последние десять лет заболеваемость туберкулезом существенно сни-зилась (с 134/100 000 в 2006 г. до 50,6/100 000 в 2015 г.), однако по-прежнему превышает средний показатель по Северо-Западному федеральному округу -40,7/100 000. Учитывая увеличение удельного веса первичной множественной лекарственной устойчивости (МЛУ) возбудителя с 23,9% в 2010 г. до 30,5% в 2015 г., целью на-стоящего исследования был анализ современной структуры популяции Mycobacterium tuberculosis в Калинин-градской области и оценка тенденций ее изменения в пространственно-временном контексте. Было изучено 73 изолята M. tuberculosis, выделенных от впервые выявленных больных туберкулезом легких в 2015 г. Лекар-ственная устойчивость (ЛУ) выявлена у 46 (63,0%) штаммов M. tuberculosis, из них 32 (43,8%) обладали муль-тирезистентностью. Установлена принадлежность к генотипу Beijing 46 (63,0%) из 73 штаммов M. tuberculosis. Доля кластера В0/W148 генотипа Beijing составила 19,2% (14 из 73). Сполиготипирование 27 штаммов nonBeijing M. tuberculosis позволило выделить 15 сполиготипов 5 генетических семейств -Т, LAM, Ural, S, X. Около половины (16; 51,6%) штаммов non-Beijing были представлены сполиготипами -SIT42, SIT53, SIT262, SIT444. В гетерогенной группе Т превалировали преимущественно лекарственно чувст вительные штаммы сполиготипа SIT53. Более половины (55,6%) штаммов генотипа LAM проявляли ЛУ. Семейство Ural было ма-лочисленно (5,5%) и включало в себя штаммы M. tuberculosis, сполиготипы которых хорошо известны в Рос-сии -SIT35 и SIT262, так и один новый, ранее не встречавшийся. МЛУ статистически значимо была связана с генотипом Beijing: 56,5% против 25,9% у штаммов прочих генотипов (суммарно) (P = 0,0134). При этом все 14 штаммов эпидемиологически и клинически значимого кластера В0/W148 были мультирезистентными. Доля МЛУ штаммов генотипа Beijing существенно не изменилась: в 2006 г. -61,3%, в 2015 г. -56,5% (P = 0,6773). Однако расширился спектр лекарственной устойчивости к противотуберкулезным препаратам пер-вого ряда: если ранее большинство (78,9%) МЛУ штаммов дополнительно проявляли устойчивость лишь к стрептомицину, то в настоящем исследовании 72,0% МЛУ штаммов были устойчивы к стрептомицину, этамбутолу и пиразинамиду. Доля МЛУ штаммов non-Beijing составила 25,9%, что существенно выше анало-гичного показателя 2006 г. -2,2% (P = 0,0124). Сравнительно меньшая доля штаммов генотипа Beijing (50%) обнаружена у больных туберкулезом, проживающих на побережье Балтийского моря, регионе с относи-тельно благополучной социально-экономической ситуацией и более высоким качеством жизни населения. Адрес для переписки:Вязовая Анна Александровна 197101, Россия, Санкт-Петербург, ул. Мира, 14, ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Пастера.

show abstract

Russian “Successful” Clone B0/W148 of Mycobacterium tuberculosis Beijing Genotype: a Multiplex PCR Assay for Rapid Detection and Global Screening

Cited by 54 publications

References 7 publications

MIRU-VNTR genotyping of clinical isolates of Mycobacterium tuberculosis from Moscow region

MIRU-VNTR genotyping of clinical isolates of Mycobacterium tuberculosis from Moscow region

Global Study of IS 6110 in a Successful Mycobacterium tuberculosis Strain: Clues for Deciphering Its Behavior and for Its Rapid Detection

Molecular Epidemiology of Tuberculosis in the Kaliningrad Region of Russia: 10 Years After

Contact Info

Product

Resources

About