La correcta selección de fuentes de semilla constituye una herramienta clave para el éxito de los programas de reforestación. Este estudio evalúo el efecto de tres procedencias (Pastaza, Napo y Orellana) sobre la morfología de las semillas, parámetros germinativos y características morfofuncionales de plántulas de Ochroma pyramidale cultivadas en vivero. Se caracterizó el ambiente edáfico de los árboles semilleros de cada procedencia, se determinó la morfología de las semillas, los parámetros de germinación y se determinaron los atributos morfofisiológicos de calidad de plantas. Se encontraron diferencias significativas (p ≤ 0.05) entre los orígenes geográficos en cuanto a las propiedades físicas y químicas del suelo (clase textural, materia orgánica, pH, Ca2+, Mg2+, N, P, K+) y los caracteres morfológicos de las semillas (ancho, espesor, relación largo/ancho y área superficial). Los porcentajes de germinación obtenidos fueron de 71.7% para Orellana, 89.0% y 92.0% para Napo y Pastaza, respectivamente. Los atributos e índices morfológicos y fisiológicos de calidad de las plantas fueron diferentes entre procedencias. Las plantas cultivadas en vivero de los orígenes geográficos de Napo y Pastaza se caracterizaron por mayor crecimiento, biomasa, lignificación, parámetros fotosintéticos y mejor calidad. Los resultados permiten afirmar que la procedencia influye en la morfología de las semillas, germinación y calidad de plantas de O. pyramidale. Se identificó la existencia de dos grupos: por un lado, las procedencias Pastaza y Napo y, por otro Orellana, lo cual resulta información de utilidad para definir zonas de movimiento de germoplasma con material mejor aclimatado a los sitios de plantación en la Amazonía ecuatoriana.