RESUMO Introdução: Nas últimas décadas, a incidência de obesidade na população pediátrica vem aumentando, juntamente com a inatividade física. A obesidade e a inatividade física são componentes predisponentes para o agravo dos fatores de risco metabólico, sendo de fundamental importância seu tratamento visando melhora da saúde dos jovens. Objetivo: Verificar o efeito de 12 semanas de uma intervenção focada na atividade física sobre os fatores de risco metabólico em crianças obesas. Métodos: A amostra final foi composta por 19 escolares com idade entre oito e 10 anos (10 no grupo pedômetro e nove no grupo controle). A atividade física foi mensurada e orientada por meio do pedômetro Yamax(r) sw 700 (Tóquio, Honchu, Japão). Para comparações intra e entre grupos foi aplicado a ANOVA two way para medidas repetidas com significância estipulada em p < 0,05. Resultados: O número de passos aumentou significativamente somente no grupo pedômetro após as 12 semanas de intervenção (pré 9729,7 ± 2539,8 vs. pós 13151,6 ± 3581,7). Foi observado aumento significativo do peso corporal, da estatura e do IMC no grupo controle. No grupo pedômetro, observou-se aumento significativo apenas na estatura. Com relação aos fatores de risco metabólicos, não foi encontrada mudança significativa no grupo controle, enquanto no grupo pedômetro foi observada diminuição significante nos valores de insulina (pré 12,21 ± 8,53 vs. pós 7,26 ± 4,70 µUI/ml) e HOMA IR (pré 2,76 ± 1,93 vs. pós 1,49 ± 0,93). Conclusão: A presente intervenção com atividade física a partir do estabelecimento de metas utilizando pedômetros reduziu significativamente as concentrações de insulina e o índice de homeostase (HOMA IR) em crianças obesas, independentemente da perda de peso.