La leptospirosis es una enfermedad transmisible de los animales y del ser humano causada por cualquiera de los agentes patógenos del género Leptospira. La infección en las especies susceptibles depende de la exposición a animales infectados o ambientes contaminados. En el Ecuador, dadas las características geográficas, medioambientales e higiénico sanitarias en áreas rurales es una de las zoonosis de presentación más frecuente en el ser humano.. El presente trabajo tuvo como finalidad determinar la frecuencia de leptospirosis en pacientes caninos atendidos en el Hospital Veterinario de la Universidad Nacional de Loja y los factores asociados a la infección. Se analizaron 100 muestras de suero canino mediante el método de MAT usando un panel de 16 serovares de Leptospira interrogans, Leptospira borgpetersenii, Leptospira santarosai y Leptospira biflexa, en el periodo noviembre 2019 - febrero 2020. Se realizó una encuesta a los propietarios para obtener información acerca de: edad, raza, sexo, procedencia, cercanía con otras especies, contacto y control de roedores, origen de aguade bebida; y, presencia de humedales, actividades del animal. Para el análisis estadístico de asociación se empleó Chi cuadrado o Test Exacto de Fisher (considerando valores de p menores o iguales a 0,05 como estadísticamente significativos). La frecuencia de leptospirosis canina fue del 29 %; los serovares para los cuales se encontraron reacciones positivas fueron Canicola, Autumnalis, Hebdomadis y Pomona. La variable origen de agua de bebida estuvo asociada con la infección por Leptospira spp. (p=0,02).