Soft rot Erwinia bacteria in the rhizosphere of weeds and crop plants in Colorado, United States and Scotland

Abstract

The soft rot coliform bacteria Erwinia carotovora subsp. carotovora and E. carotovora subsp. atroseptica were isolated by an enrichment method from the rhizosphere of many weed species and crop plants, collected in commercial potato fields either currently in potatoes or in a different crop as part of the rotation. Erwinia carotovora was isolated from 24 plant species in Colorado and 47 species in Scotland. Weeds contaminated with E. carotovora were found in fields growing other crops in which potatoes had not been grown for 1–2 and sometimes much longer. Weeds collected from virgin land in Colorado were not contaminated with E. carotovora but in Scotland virgin soils containing weed roots yielded E. carotovora subsp. carotovora. In general, the numbers of contaminated weeds rose from nil or low levels in spring and early summer to considerably higher levels during mid‐season, and fell to progressively lower levels later. Erwinia carotovora subsp. carotovora was the predominant organism recovered from the rhizosphere, but E. carotovora subsp. atroseptica was less common, especially in Scotland, and its incidence varied in different seasons depending on factors such as temperature and moisture conditions. The bacteria could apparently persist in the root zone for an extended period of time and may be a source of inoculum to contaminate soft rot erwinia‐free seed potato stocks; the origin of the bacteria was uncertain.

The Type III Secreted Effector DspE Is Required Early in Solanum tuberosum Leaf Infection by Pectobacterium carotovorum to Cause Cell Death, and Requires Wx(3–6)D/E Motifs

“…It is a ubiquitous pathogen that survives in soil, surface and ground water, and it has been associated with a variety of invertebrates [1], [2], [3], [4]. P. carotovorum attacks plant tissue by secreting an array of plant cell wall degrading enzymes through the type II secretion system [5], [6], [7], [8], [9], [10].…”

Caractérisation par PCR de deux souches d’Erwinia carotovora isolées de la rhizosphère de la pomme de terre dans la région du grand Casablanca au Maroc

“…La faible fréquence de ces bactéries dans le sol a été expliquée par l'influence de certains facteurs, comme la faible disponibilité des nutriments (surtout lors de la récolte et 0,29 0,09 0,12 0,87 0,27 0,36 0,31 0,14 0,15 1,1 0,46 0,38 0,29 0,1 0,12 0,88 0,36 0,38 0,29 0,14 0,1 1,1 0,42 0,3 0,28 0,09 0,12 1,33 0,3 0,36 0,3 0,09 0,1 1,1 0,32 0,3 0,32 0,12 0,12 0,96 0,34 0,36 0,34 0,14 0,15 1,02 0,42 0,3 0,3 0,09 0,12 0,96 0,27 0,36 0,28 0,08 0,11 1,07 0,24 0,33 0,32 0,13 0,14 1,19 0,39 0,36 0,3 0,14 0,15 0,96 0,42 0,39 des rotations), la température et l'humidité (Pérombelon & Hyman, 1989). Cependant ceci n'exclut pas l'éventualité de leur persistance dans ce milieu hostile (McCarter-Zorner et al, 1985) ni l'importance du sol dans la transmission puisque ce dernier véhicule des souches qui peuvent infecter les tubercules de pomme de terre. Ces souches présentes dans le sol sont capables de provoquer la pourriture molle sur la pomme de terre.…”

Pectobacterium spp. et Dickeya spp. de la pomme de terre : nouvelle nomenclature pour Erwinia spp. symptomatologie épidémiolo

“…dans le sol et la rhizosphère présentent des points de vue contradictoires, alors que peu de données existent pour les Dickeya spp., Stanghellini (1982) et McCarter-Zorner et al (1985 considèrent en effet que les Pectobacterium sont des organismes du « sol » dont le niveau de population augmente fortement en pré-sence d'exsudats racinaires de plantes (adventices ou cultures). Inversement, en cas d'absence ou de quantités moindres de nutriments liées à la récolte ou la maturité des plantes, la population bacté-rienne diminue jusqu'à un niveau non détectable.…”

“…Les études menées par Van der Wolf et al (2007) montrent, quant à elles, que les Dickeya ne survivent pas plus de trois semaines dans un sol nu. Toutefois, des études (Burr et Schroth, 1977 ;McCarter-Zorner et al, 1985) mettent en évidence la présence de Pectobacterium au sein de la rhizosphère de diffé-rentes cultures (laitues, carottes, betteraves à sucre). Les cultures de brassicacae (brocoli, colza, rutabaga, navet, chou) sont reconnues comme hébergeant Pectobacterium fréquemment et à des niveaux relativement élevés (McCarterZorner et al, 1985 ;Pérombelon et Hyman, 1989).…”

“…Les cultures de brassicacae (brocoli, colza, rutabaga, navet, chou) sont reconnues comme hébergeant Pectobacterium fréquemment et à des niveaux relativement élevés (McCarterZorner et al, 1985 ;Pérombelon et Hyman, 1989). Les bactéries sont égale-ment isolées à partir de rhizosphères d'adventices (laiteron, mouron, pâturin, amarante, chénopode blanc, renouée) (Burr et Schroth, 1977 ;McCarter-Zorner et al, 1985). Peu d'informations existent concernant le potentiel de survie des Dickeya spp., hormis leur description sur des morelles douces amères (Olsson, 1985).…”