Soil Microbial Community Analysis in Large Patch (Rhizoctonia solani AG2-2 IV)

Abstract

서 론Metagenomics를 이용한 미생물상 분석법은, 다양한 토양 미생물의 대량 분석을 가능하게 했을 뿐 아니라. 배양이 불 가능한 미생물의 분포 조사에 이용되고 있다 (Amann et al., 1995). 현재 사용되고 있는 미생물 분류 및 동정 방법은 생 화학적 방법으로 미생물의 특성을 검정하거나 rRNA의 염 기서열을 분석하는 분자생물학적 방법으로 이루어지고 있 다 (Woese and Fox, 1977;Woese et al., 1990 ABSTRACT. Large patch, caused by Rhizoctonia solani AG2-2 IV, is a soil-born disease that is the most important of warm season turfgrass such as zoysia and Bermuda grass. This study was conducted to analysis of the soil microbial community structure on large patch. Center of the large patch (CLC), edge (CLE) and healthy (CLH) part of microbial communities were examined using metagenomics in Phylum level. Distribution trends of the rhizosphere microorganisms were similar to the order Proteobacteria, Acidobacteria, Chloroflexi, Firmicutes, Planctomycetes, Gemmatimonadetes, Nitrospira, Cyanobactria and Verrucomicrobia in soil collections. Contrastively Actinobacteria was more 56% abundant in healthy part soil (16%) than in the center (9.28%) or edge (10.84%) parts. Taxonomic distributions were compared among the CLC, CLE and CLH, total 6,948 OTUs were detected in the CLC, 6,505 OTUs for the CLE and 5,537 OTUs were detected in the CLE. Distributions of Actinobacteria OTUs were appeared 615 OTUs in the CLC, 709 OTUs in the CLE and 891 OTUs in the CLH. Among Actinobacteria, 382 OTUs were overlapped in the all soils. Not matched OTUs of CLH (286 OTUs) was detected 23 times higher than CLC (91 OTUs) and CLE (126 OTUs).

Biological Control of Large Patch Disease by Streptomyces spp. in Turfgrass

“…공시 균주 및 병원균 접종원 제조 공시 균주는 본 연구진이 메타지노믹스 분석 (Lee et al, 2015b), 갈색퍼짐병 방제 농약별 살균제내성 (Lee et al, 2015a), 분리 균주의 생리학적 특성 (Lee et al, 2015c) 로 밀도가 유사하게 나타났다. S8 균주는 1주에서 4 주차까지 6.6, 6.7, 6.6과 6.7 log cfu g −1 로 밀도의 변화가 거 의 없는 것으로 나타났다.…”

“…이러한 농약 사용으로 인해 토양, 수질, 생물다양성에 문제를 일으 키며, 또한 병원균이 농약에 저항성을 가지게 하여 궁극적 으로는 더 높은 농도의 농약을 사용하여야 방제가 되는 악 순환이 반복 되고 있다. 이러한 문제를 극복하기 위하여 본 연구는 잔디 재배지 에서 생물적 방제제로 이용하기 위한 목적으로 근권부 메 타게놈 선행연구 (Lee et al, 2015b) …”