Las estrategias de conservación pueden no resultar efectivas al no considerar los factores naturales como la vegetación, ecosistemas y formaciones geológicas donde los primates pueden ser escasos o estar ausentes de forma natural. Esto nos motivó a estudiar la densidad de primates en ecosistema inundable y de tierra firme, en vegetación de bosque inundable de palmeras o aguajal (Bip), bosque de terraza baja (Btb), bosque de colina baja (Bcb) y bosque de terraza alta (Bta), y en las formaciones geológicas Pebas y Nauta en la Reserva Nacional Pucacuro. Utilizamos 21 transectos, 3 estuvieron en Bip, 5 en Btb, 3 en Bta y 10 en Bcb, y recorrimos un total de 335,2 y 103,6 km en Btb y Bip, y 337,1 y 1323,6 km en Bta y Bcb, respectivamente. Nuestros resultados indican que Cebus apella, Saimiri cassiquiarensis fueron abundantes en el ecosistema inundable, en el Bip y Btb. Lagothrix lagotricha poeppigii fue abundante en el ecosistema de tierra firme, específicamente en Bta y Bcb. Plecturocebus discolor fue abundante solamente en bosque de terraza baja. Las formaciones geológicas afectaron a la abundancia de Callimico goeldii y Ateles belzebuth, quienes se restringieron al Bcb de la Formación Nauta inferior y Formación Pebas, respectivamente. Otras especies de primates no fueron afectadas por estos factores naturales.